Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBM3

Gm16223, MCG145574 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16223Q8CBM3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm16223Q8CBM3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm16223Q8CBM3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm16223Q8CBM3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm16223Q8CBM3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm16223Q8CBM3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm16223Q8CBM3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm16223Q8CBM3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm16223Q8CBM3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm16223Q8CBM3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm16223Q8CBM3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm16223Q8CBM3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm16223Q8CBM3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm16223Q8CBM3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm16223Q8CBM3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm16223Q8CBM3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm16223Q8CBM3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm16223Q8CBM3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm16223Q8CBM3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm16223Q8CBM3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm16223Q8CBM3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm16223Q8CBM3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm16223Q8CBM3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm16223Q8CBM3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm16223Q8CBM3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm16223Q8CBM3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm16223Q8CBM3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm16223Q8CBM3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm16223Q8CBM3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm16223Q8CBM3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm16223Q8CBM3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm16223Q8CBM3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm16223Q8CBM3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm16223Q8CBM3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm16223Q8CBM3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm16223Q8CBM3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm16223Q8CBM3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm16223Q8CBM3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm16223Q8CBM3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm16223Q8CBM3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm16223Q8CBM3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm16223Q8CBM3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm16223Q8CBM3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm16223Q8CBM3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm16223Q8CBM3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm16223Q8CBM3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm16223Q8CBM3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm16223Q8CBM3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm16223Q8CBM3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm16223Q8CBM3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm16223Q8CBM3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm16223Q8CBM3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm16223Q8CBM3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm16223Q8CBM3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm16223Q8CBM3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm16223Q8CBM3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm16223Q8CBM3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm16223Q8CBM3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm16223Q8CBM3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm16223Q8CBM3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm16223Q8CBM3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm16223Q8CBM3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm16223Q8CBM3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm16223Q8CBM3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm16223Q8CBM3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm16223Q8CBM3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm16223Q8CBM3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm16223Q8CBM3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm16223Q8CBM3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm16223Q8CBM3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm16223Q8CBM3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm16223Q8CBM3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm16223Q8CBM3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm16223Q8CBM3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm16223Q8CBM3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm16223Q8CBM3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm16223Q8CBM3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm16223Q8CBM3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm16223Q8CBM3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm16223Q8CBM3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm16223Q8CBM3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm16223Q8CBM3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm16223Q8CBM3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm16223Q8CBM3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm16223Q8CBM3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm16223Q8CBM3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm16223Q8CBM3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm16223Q8CBM3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm16223Q8CBM3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm16223Q8CBM3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm16223Q8CBM3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm16223Q8CBM3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm16223Q8CBM3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm16223Q8CBM3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm16223Q8CBM3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm16223Q8CBM3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm16223Q8CBM3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm16223Q8CBM3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm16223Q8CBM3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm16223Q8CBM3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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