Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5Z9

4930504O13Rik, RIKEN cDNA 4930504O13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930504O13RikQ8C5Z9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
4930504O13RikQ8C5Z9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
4930504O13RikQ8C5Z9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
4930504O13RikQ8C5Z9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
4930504O13RikQ8C5Z9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
4930504O13RikQ8C5Z9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
4930504O13RikQ8C5Z9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
4930504O13RikQ8C5Z9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
4930504O13RikQ8C5Z9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
4930504O13RikQ8C5Z9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
4930504O13RikQ8C5Z9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
4930504O13RikQ8C5Z9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
4930504O13RikQ8C5Z9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
4930504O13RikQ8C5Z9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
4930504O13RikQ8C5Z9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
4930504O13RikQ8C5Z9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
4930504O13RikQ8C5Z9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
4930504O13RikQ8C5Z9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
4930504O13RikQ8C5Z9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
4930504O13RikQ8C5Z9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
4930504O13RikQ8C5Z9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
4930504O13RikQ8C5Z9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
4930504O13RikQ8C5Z9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
4930504O13RikQ8C5Z9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
4930504O13RikQ8C5Z9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
4930504O13RikQ8C5Z9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
4930504O13RikQ8C5Z9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
4930504O13RikQ8C5Z9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
4930504O13RikQ8C5Z9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
4930504O13RikQ8C5Z9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
4930504O13RikQ8C5Z9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
4930504O13RikQ8C5Z9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
4930504O13RikQ8C5Z9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
4930504O13RikQ8C5Z9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
4930504O13RikQ8C5Z9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
4930504O13RikQ8C5Z9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
4930504O13RikQ8C5Z9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
4930504O13RikQ8C5Z9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
4930504O13RikQ8C5Z9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
4930504O13RikQ8C5Z9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
4930504O13RikQ8C5Z9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
4930504O13RikQ8C5Z9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
4930504O13RikQ8C5Z9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
4930504O13RikQ8C5Z9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
4930504O13RikQ8C5Z9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
4930504O13RikQ8C5Z9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
4930504O13RikQ8C5Z9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
4930504O13RikQ8C5Z9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
4930504O13RikQ8C5Z9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
4930504O13RikQ8C5Z9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
4930504O13RikQ8C5Z9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
4930504O13RikQ8C5Z9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
4930504O13RikQ8C5Z9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
4930504O13RikQ8C5Z9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
4930504O13RikQ8C5Z9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
4930504O13RikQ8C5Z9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
4930504O13RikQ8C5Z9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
4930504O13RikQ8C5Z9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
4930504O13RikQ8C5Z9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
4930504O13RikQ8C5Z9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
4930504O13RikQ8C5Z9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
4930504O13RikQ8C5Z9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
4930504O13RikQ8C5Z9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
4930504O13RikQ8C5Z9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
4930504O13RikQ8C5Z9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
4930504O13RikQ8C5Z9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
4930504O13RikQ8C5Z9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
4930504O13RikQ8C5Z9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
4930504O13RikQ8C5Z9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
4930504O13RikQ8C5Z9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
4930504O13RikQ8C5Z9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
4930504O13RikQ8C5Z9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
4930504O13RikQ8C5Z9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
4930504O13RikQ8C5Z9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
4930504O13RikQ8C5Z9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
4930504O13RikQ8C5Z9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
4930504O13RikQ8C5Z9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
4930504O13RikQ8C5Z9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
4930504O13RikQ8C5Z9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
4930504O13RikQ8C5Z9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
4930504O13RikQ8C5Z9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
4930504O13RikQ8C5Z9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
4930504O13RikQ8C5Z9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
4930504O13RikQ8C5Z9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
4930504O13RikQ8C5Z9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
4930504O13RikQ8C5Z9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
4930504O13RikQ8C5Z9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
4930504O13RikQ8C5Z9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms