Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMJ8

Sp8, Transcription factor Sp8, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp8Q8BMJ8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Sp8Q8BMJ8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sp8Q8BMJ8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sp8Q8BMJ8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sp8Q8BMJ8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Sp8Q8BMJ8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sp8Q8BMJ8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sp8Q8BMJ8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sp8Q8BMJ8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sp8Q8BMJ8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Sp8Q8BMJ8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sp8Q8BMJ8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sp8Q8BMJ8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sp8Q8BMJ8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sp8Q8BMJ8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sp8Q8BMJ8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sp8Q8BMJ8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sp8Q8BMJ8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sp8Q8BMJ8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sp8Q8BMJ8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sp8Q8BMJ8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Sp8Q8BMJ8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sp8Q8BMJ8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sp8Q8BMJ8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sp8Q8BMJ8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sp8Q8BMJ8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sp8Q8BMJ8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Sp8Q8BMJ8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sp8Q8BMJ8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sp8Q8BMJ8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sp8Q8BMJ8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sp8Q8BMJ8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sp8Q8BMJ8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Sp8Q8BMJ8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sp8Q8BMJ8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sp8Q8BMJ8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sp8Q8BMJ8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sp8Q8BMJ8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sp8Q8BMJ8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sp8Q8BMJ8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sp8Q8BMJ8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sp8Q8BMJ8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sp8Q8BMJ8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sp8Q8BMJ8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sp8Q8BMJ8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sp8Q8BMJ8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sp8Q8BMJ8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sp8Q8BMJ8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sp8Q8BMJ8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sp8Q8BMJ8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sp8Q8BMJ8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sp8Q8BMJ8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sp8Q8BMJ8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sp8Q8BMJ8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sp8Q8BMJ8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sp8Q8BMJ8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sp8Q8BMJ8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sp8Q8BMJ8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sp8Q8BMJ8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sp8Q8BMJ8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sp8Q8BMJ8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sp8Q8BMJ8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sp8Q8BMJ8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sp8Q8BMJ8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sp8Q8BMJ8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sp8Q8BMJ8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sp8Q8BMJ8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sp8Q8BMJ8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sp8Q8BMJ8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sp8Q8BMJ8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sp8Q8BMJ8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sp8Q8BMJ8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sp8Q8BMJ8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sp8Q8BMJ8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sp8Q8BMJ8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sp8Q8BMJ8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sp8Q8BMJ8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sp8Q8BMJ8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sp8Q8BMJ8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sp8Q8BMJ8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sp8Q8BMJ8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sp8Q8BMJ8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sp8Q8BMJ8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sp8Q8BMJ8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sp8Q8BMJ8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sp8Q8BMJ8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sp8Q8BMJ8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sp8Q8BMJ8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sp8Q8BMJ8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sp8Q8BMJ8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sp8Q8BMJ8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sp8Q8BMJ8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sp8Q8BMJ8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sp8Q8BMJ8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Sp8Q8BMJ8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sp8Q8BMJ8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sp8Q8BMJ8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sp8Q8BMJ8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sp8Q8BMJ8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sp8Q8BMJ8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms