Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH01

Tmco3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco3Q8BH01 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmco3Q8BH01 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmco3Q8BH01 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmco3Q8BH01 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmco3Q8BH01 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmco3Q8BH01 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmco3Q8BH01 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmco3Q8BH01 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmco3Q8BH01 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmco3Q8BH01 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmco3Q8BH01 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmco3Q8BH01 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmco3Q8BH01 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmco3Q8BH01 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmco3Q8BH01 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmco3Q8BH01 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmco3Q8BH01 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmco3Q8BH01 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmco3Q8BH01 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmco3Q8BH01 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmco3Q8BH01 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmco3Q8BH01 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmco3Q8BH01 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmco3Q8BH01 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmco3Q8BH01 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmco3Q8BH01 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmco3Q8BH01 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmco3Q8BH01 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmco3Q8BH01 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmco3Q8BH01 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmco3Q8BH01 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmco3Q8BH01 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmco3Q8BH01 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmco3Q8BH01 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmco3Q8BH01 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmco3Q8BH01 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmco3Q8BH01 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmco3Q8BH01 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmco3Q8BH01 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmco3Q8BH01 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmco3Q8BH01 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmco3Q8BH01 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmco3Q8BH01 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmco3Q8BH01 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmco3Q8BH01 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmco3Q8BH01 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmco3Q8BH01 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmco3Q8BH01 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmco3Q8BH01 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmco3Q8BH01 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmco3Q8BH01 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmco3Q8BH01 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmco3Q8BH01 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmco3Q8BH01 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmco3Q8BH01 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmco3Q8BH01 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmco3Q8BH01 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmco3Q8BH01 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmco3Q8BH01 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmco3Q8BH01 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmco3Q8BH01 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmco3Q8BH01 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmco3Q8BH01 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmco3Q8BH01 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmco3Q8BH01 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmco3Q8BH01 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmco3Q8BH01 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmco3Q8BH01 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmco3Q8BH01 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmco3Q8BH01 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmco3Q8BH01 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmco3Q8BH01 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmco3Q8BH01 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmco3Q8BH01 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmco3Q8BH01 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmco3Q8BH01 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmco3Q8BH01 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmco3Q8BH01 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmco3Q8BH01 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmco3Q8BH01 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmco3Q8BH01 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmco3Q8BH01 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmco3Q8BH01 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmco3Q8BH01 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmco3Q8BH01 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmco3Q8BH01 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmco3Q8BH01 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmco3Q8BH01 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmco3Q8BH01 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmco3Q8BH01 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmco3Q8BH01 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmco3Q8BH01 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmco3Q8BH01 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmco3Q8BH01 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmco3Q8BH01 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmco3Q8BH01 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmco3Q8BH01 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmco3Q8BH01 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmco3Q8BH01 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmco3Q8BH01 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms