Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFU8

Slc17a8, Vesicular glutamate transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc17a8Q8BFU8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc17a8Q8BFU8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc17a8Q8BFU8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc17a8Q8BFU8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc17a8Q8BFU8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc17a8Q8BFU8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc17a8Q8BFU8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc17a8Q8BFU8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc17a8Q8BFU8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc17a8Q8BFU8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc17a8Q8BFU8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc17a8Q8BFU8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc17a8Q8BFU8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc17a8Q8BFU8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc17a8Q8BFU8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc17a8Q8BFU8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc17a8Q8BFU8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc17a8Q8BFU8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc17a8Q8BFU8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc17a8Q8BFU8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc17a8Q8BFU8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc17a8Q8BFU8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc17a8Q8BFU8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc17a8Q8BFU8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc17a8Q8BFU8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc17a8Q8BFU8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc17a8Q8BFU8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc17a8Q8BFU8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc17a8Q8BFU8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc17a8Q8BFU8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc17a8Q8BFU8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc17a8Q8BFU8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc17a8Q8BFU8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc17a8Q8BFU8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc17a8Q8BFU8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc17a8Q8BFU8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc17a8Q8BFU8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc17a8Q8BFU8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc17a8Q8BFU8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc17a8Q8BFU8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc17a8Q8BFU8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc17a8Q8BFU8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc17a8Q8BFU8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc17a8Q8BFU8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc17a8Q8BFU8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc17a8Q8BFU8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc17a8Q8BFU8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc17a8Q8BFU8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc17a8Q8BFU8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc17a8Q8BFU8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc17a8Q8BFU8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc17a8Q8BFU8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc17a8Q8BFU8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc17a8Q8BFU8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc17a8Q8BFU8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc17a8Q8BFU8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc17a8Q8BFU8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc17a8Q8BFU8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc17a8Q8BFU8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc17a8Q8BFU8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc17a8Q8BFU8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc17a8Q8BFU8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc17a8Q8BFU8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc17a8Q8BFU8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc17a8Q8BFU8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc17a8Q8BFU8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc17a8Q8BFU8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc17a8Q8BFU8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc17a8Q8BFU8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc17a8Q8BFU8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc17a8Q8BFU8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc17a8Q8BFU8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc17a8Q8BFU8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc17a8Q8BFU8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc17a8Q8BFU8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc17a8Q8BFU8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc17a8Q8BFU8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc17a8Q8BFU8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc17a8Q8BFU8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc17a8Q8BFU8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc17a8Q8BFU8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc17a8Q8BFU8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc17a8Q8BFU8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc17a8Q8BFU8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc17a8Q8BFU8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc17a8Q8BFU8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc17a8Q8BFU8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc17a8Q8BFU8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc17a8Q8BFU8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc17a8Q8BFU8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc17a8Q8BFU8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc17a8Q8BFU8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc17a8Q8BFU8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc17a8Q8BFU8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc17a8Q8BFU8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc17a8Q8BFU8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc17a8Q8BFU8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc17a8Q8BFU8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc17a8Q8BFU8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc17a8Q8BFU8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms