Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFT6

Jmjd4, JmjC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd4Q8BFT6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Jmjd4Q8BFT6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Jmjd4Q8BFT6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Jmjd4Q8BFT6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Jmjd4Q8BFT6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Jmjd4Q8BFT6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Jmjd4Q8BFT6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Jmjd4Q8BFT6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Jmjd4Q8BFT6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Jmjd4Q8BFT6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Jmjd4Q8BFT6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Jmjd4Q8BFT6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Jmjd4Q8BFT6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Jmjd4Q8BFT6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Jmjd4Q8BFT6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Jmjd4Q8BFT6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Jmjd4Q8BFT6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Jmjd4Q8BFT6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Jmjd4Q8BFT6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Jmjd4Q8BFT6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Jmjd4Q8BFT6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Jmjd4Q8BFT6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Jmjd4Q8BFT6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Jmjd4Q8BFT6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Jmjd4Q8BFT6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Jmjd4Q8BFT6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Jmjd4Q8BFT6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Jmjd4Q8BFT6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Jmjd4Q8BFT6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Jmjd4Q8BFT6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Jmjd4Q8BFT6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Jmjd4Q8BFT6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Jmjd4Q8BFT6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Jmjd4Q8BFT6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Jmjd4Q8BFT6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Jmjd4Q8BFT6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Jmjd4Q8BFT6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Jmjd4Q8BFT6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Jmjd4Q8BFT6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Jmjd4Q8BFT6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Jmjd4Q8BFT6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Jmjd4Q8BFT6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Jmjd4Q8BFT6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Jmjd4Q8BFT6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Jmjd4Q8BFT6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Jmjd4Q8BFT6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Jmjd4Q8BFT6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Jmjd4Q8BFT6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Jmjd4Q8BFT6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Jmjd4Q8BFT6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Jmjd4Q8BFT6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Jmjd4Q8BFT6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Jmjd4Q8BFT6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Jmjd4Q8BFT6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Jmjd4Q8BFT6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Jmjd4Q8BFT6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Jmjd4Q8BFT6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Jmjd4Q8BFT6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Jmjd4Q8BFT6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Jmjd4Q8BFT6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Jmjd4Q8BFT6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Jmjd4Q8BFT6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Jmjd4Q8BFT6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Jmjd4Q8BFT6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Jmjd4Q8BFT6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Jmjd4Q8BFT6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Jmjd4Q8BFT6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Jmjd4Q8BFT6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Jmjd4Q8BFT6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Jmjd4Q8BFT6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Jmjd4Q8BFT6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Jmjd4Q8BFT6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Jmjd4Q8BFT6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Jmjd4Q8BFT6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Jmjd4Q8BFT6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Jmjd4Q8BFT6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Jmjd4Q8BFT6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Jmjd4Q8BFT6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Jmjd4Q8BFT6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Jmjd4Q8BFT6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Jmjd4Q8BFT6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Jmjd4Q8BFT6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Jmjd4Q8BFT6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Jmjd4Q8BFT6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Jmjd4Q8BFT6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Jmjd4Q8BFT6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Jmjd4Q8BFT6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Jmjd4Q8BFT6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Jmjd4Q8BFT6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Jmjd4Q8BFT6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Jmjd4Q8BFT6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Jmjd4Q8BFT6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Jmjd4Q8BFT6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Jmjd4Q8BFT6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Jmjd4Q8BFT6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Jmjd4Q8BFT6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Jmjd4Q8BFT6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Jmjd4Q8BFT6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Jmjd4Q8BFT6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Jmjd4Q8BFT6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms