Protein–RNA interactions for Protein: Q80VW7

Akna, AT-hook-containing transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AknaQ80VW7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
AknaQ80VW7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
AknaQ80VW7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
AknaQ80VW7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
AknaQ80VW7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
AknaQ80VW7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC31.89■■■□□ 2.7
AknaQ80VW7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
AknaQ80VW7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
AknaQ80VW7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
AknaQ80VW7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
AknaQ80VW7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
AknaQ80VW7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
AknaQ80VW7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
AknaQ80VW7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
AknaQ80VW7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
AknaQ80VW7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
AknaQ80VW7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
AknaQ80VW7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
AknaQ80VW7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
AknaQ80VW7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
AknaQ80VW7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
AknaQ80VW7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
AknaQ80VW7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
AknaQ80VW7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
AknaQ80VW7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
AknaQ80VW7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
AknaQ80VW7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
AknaQ80VW7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
AknaQ80VW7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
AknaQ80VW7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
AknaQ80VW7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
AknaQ80VW7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
AknaQ80VW7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
AknaQ80VW7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
AknaQ80VW7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
AknaQ80VW7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
AknaQ80VW7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
AknaQ80VW7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
AknaQ80VW7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
AknaQ80VW7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
AknaQ80VW7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
AknaQ80VW7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
AknaQ80VW7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
AknaQ80VW7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
AknaQ80VW7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
AknaQ80VW7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
AknaQ80VW7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC31.81■■■□□ 2.68
AknaQ80VW7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC31.81■■■□□ 2.68
AknaQ80VW7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
AknaQ80VW7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
AknaQ80VW7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
AknaQ80VW7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
AknaQ80VW7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
AknaQ80VW7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
AknaQ80VW7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
AknaQ80VW7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
AknaQ80VW7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
AknaQ80VW7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
AknaQ80VW7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
AknaQ80VW7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
AknaQ80VW7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
AknaQ80VW7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
AknaQ80VW7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
AknaQ80VW7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
AknaQ80VW7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
AknaQ80VW7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
AknaQ80VW7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
AknaQ80VW7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
AknaQ80VW7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
AknaQ80VW7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
AknaQ80VW7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
AknaQ80VW7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
AknaQ80VW7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
AknaQ80VW7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
AknaQ80VW7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
AknaQ80VW7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
AknaQ80VW7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
AknaQ80VW7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
AknaQ80VW7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
AknaQ80VW7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC31.75■■■□□ 2.67
AknaQ80VW7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC31.75■■■□□ 2.67
AknaQ80VW7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
AknaQ80VW7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
AknaQ80VW7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
AknaQ80VW7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
AknaQ80VW7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
AknaQ80VW7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
AknaQ80VW7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
AknaQ80VW7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
AknaQ80VW7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
AknaQ80VW7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
AknaQ80VW7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
AknaQ80VW7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
AknaQ80VW7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
AknaQ80VW7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
AknaQ80VW7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
AknaQ80VW7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
AknaQ80VW7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
AknaQ80VW7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC31.72■■■□□ 2.67
AknaQ80VW7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms