Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sgo2Q7TSY8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sgo2Q7TSY8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sgo2Q7TSY8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sgo2Q7TSY8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sgo2Q7TSY8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sgo2Q7TSY8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sgo2Q7TSY8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sgo2Q7TSY8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sgo2Q7TSY8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Sgo2Q7TSY8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sgo2Q7TSY8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sgo2Q7TSY8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sgo2Q7TSY8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sgo2Q7TSY8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sgo2Q7TSY8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sgo2Q7TSY8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Sgo2Q7TSY8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sgo2Q7TSY8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sgo2Q7TSY8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Sgo2Q7TSY8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sgo2Q7TSY8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sgo2Q7TSY8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sgo2Q7TSY8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sgo2Q7TSY8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sgo2Q7TSY8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sgo2Q7TSY8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sgo2Q7TSY8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sgo2Q7TSY8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sgo2Q7TSY8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sgo2Q7TSY8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sgo2Q7TSY8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Sgo2Q7TSY8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sgo2Q7TSY8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sgo2Q7TSY8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sgo2Q7TSY8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sgo2Q7TSY8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sgo2Q7TSY8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sgo2Q7TSY8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sgo2Q7TSY8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sgo2Q7TSY8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sgo2Q7TSY8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sgo2Q7TSY8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sgo2Q7TSY8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sgo2Q7TSY8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sgo2Q7TSY8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sgo2Q7TSY8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sgo2Q7TSY8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sgo2Q7TSY8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sgo2Q7TSY8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sgo2Q7TSY8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sgo2Q7TSY8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sgo2Q7TSY8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sgo2Q7TSY8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sgo2Q7TSY8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sgo2Q7TSY8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sgo2Q7TSY8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sgo2Q7TSY8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sgo2Q7TSY8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sgo2Q7TSY8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sgo2Q7TSY8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sgo2Q7TSY8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sgo2Q7TSY8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sgo2Q7TSY8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sgo2Q7TSY8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sgo2Q7TSY8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sgo2Q7TSY8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sgo2Q7TSY8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sgo2Q7TSY8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sgo2Q7TSY8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sgo2Q7TSY8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sgo2Q7TSY8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sgo2Q7TSY8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sgo2Q7TSY8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sgo2Q7TSY8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sgo2Q7TSY8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sgo2Q7TSY8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Sgo2Q7TSY8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Sgo2Q7TSY8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sgo2Q7TSY8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sgo2Q7TSY8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sgo2Q7TSY8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sgo2Q7TSY8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sgo2Q7TSY8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sgo2Q7TSY8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sgo2Q7TSY8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sgo2Q7TSY8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sgo2Q7TSY8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sgo2Q7TSY8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sgo2Q7TSY8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sgo2Q7TSY8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sgo2Q7TSY8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sgo2Q7TSY8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sgo2Q7TSY8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sgo2Q7TSY8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sgo2Q7TSY8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sgo2Q7TSY8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sgo2Q7TSY8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sgo2Q7TSY8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sgo2Q7TSY8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms