Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSA6

Proser3, Proline and serine-rich protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Proser3Q7TSA6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Proser3Q7TSA6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Proser3Q7TSA6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Proser3Q7TSA6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Proser3Q7TSA6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Proser3Q7TSA6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Proser3Q7TSA6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Proser3Q7TSA6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Proser3Q7TSA6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Proser3Q7TSA6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Proser3Q7TSA6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Proser3Q7TSA6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Proser3Q7TSA6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Proser3Q7TSA6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Proser3Q7TSA6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Proser3Q7TSA6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Proser3Q7TSA6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Proser3Q7TSA6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Proser3Q7TSA6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Proser3Q7TSA6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Proser3Q7TSA6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Proser3Q7TSA6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Proser3Q7TSA6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Proser3Q7TSA6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Proser3Q7TSA6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Proser3Q7TSA6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Proser3Q7TSA6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Proser3Q7TSA6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Proser3Q7TSA6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Proser3Q7TSA6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Proser3Q7TSA6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Proser3Q7TSA6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Proser3Q7TSA6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Proser3Q7TSA6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Proser3Q7TSA6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Proser3Q7TSA6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Proser3Q7TSA6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Proser3Q7TSA6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Proser3Q7TSA6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Proser3Q7TSA6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Proser3Q7TSA6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Proser3Q7TSA6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Proser3Q7TSA6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Proser3Q7TSA6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Proser3Q7TSA6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Proser3Q7TSA6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Proser3Q7TSA6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Proser3Q7TSA6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Proser3Q7TSA6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Proser3Q7TSA6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Proser3Q7TSA6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Proser3Q7TSA6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Proser3Q7TSA6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Proser3Q7TSA6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Proser3Q7TSA6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Proser3Q7TSA6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Proser3Q7TSA6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Proser3Q7TSA6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Proser3Q7TSA6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Proser3Q7TSA6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Proser3Q7TSA6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Proser3Q7TSA6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Proser3Q7TSA6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Proser3Q7TSA6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Proser3Q7TSA6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Proser3Q7TSA6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Proser3Q7TSA6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Proser3Q7TSA6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Proser3Q7TSA6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Proser3Q7TSA6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Proser3Q7TSA6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Proser3Q7TSA6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Proser3Q7TSA6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Proser3Q7TSA6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Proser3Q7TSA6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Proser3Q7TSA6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Proser3Q7TSA6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Proser3Q7TSA6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Proser3Q7TSA6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Proser3Q7TSA6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Proser3Q7TSA6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Proser3Q7TSA6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Proser3Q7TSA6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Proser3Q7TSA6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Proser3Q7TSA6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Proser3Q7TSA6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Proser3Q7TSA6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Proser3Q7TSA6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Proser3Q7TSA6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Proser3Q7TSA6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Proser3Q7TSA6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Proser3Q7TSA6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Proser3Q7TSA6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Proser3Q7TSA6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Proser3Q7TSA6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Proser3Q7TSA6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Proser3Q7TSA6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Proser3Q7TSA6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Proser3Q7TSA6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Proser3Q7TSA6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 660.7 ms