Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sys1Q78S06 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sys1Q78S06 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sys1Q78S06 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sys1Q78S06 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sys1Q78S06 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sys1Q78S06 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sys1Q78S06 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sys1Q78S06 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sys1Q78S06 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sys1Q78S06 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sys1Q78S06 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sys1Q78S06 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sys1Q78S06 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sys1Q78S06 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sys1Q78S06 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sys1Q78S06 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sys1Q78S06 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sys1Q78S06 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sys1Q78S06 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sys1Q78S06 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sys1Q78S06 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sys1Q78S06 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sys1Q78S06 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sys1Q78S06 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sys1Q78S06 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sys1Q78S06 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sys1Q78S06 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sys1Q78S06 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sys1Q78S06 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sys1Q78S06 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sys1Q78S06 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sys1Q78S06 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sys1Q78S06 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sys1Q78S06 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sys1Q78S06 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sys1Q78S06 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sys1Q78S06 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sys1Q78S06 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sys1Q78S06 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sys1Q78S06 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sys1Q78S06 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sys1Q78S06 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sys1Q78S06 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sys1Q78S06 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sys1Q78S06 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sys1Q78S06 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sys1Q78S06 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sys1Q78S06 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sys1Q78S06 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sys1Q78S06 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sys1Q78S06 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sys1Q78S06 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sys1Q78S06 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sys1Q78S06 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sys1Q78S06 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sys1Q78S06 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sys1Q78S06 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sys1Q78S06 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sys1Q78S06 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sys1Q78S06 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sys1Q78S06 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sys1Q78S06 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sys1Q78S06 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sys1Q78S06 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sys1Q78S06 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sys1Q78S06 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sys1Q78S06 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sys1Q78S06 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sys1Q78S06 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sys1Q78S06 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sys1Q78S06 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sys1Q78S06 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sys1Q78S06 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sys1Q78S06 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sys1Q78S06 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sys1Q78S06 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sys1Q78S06 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sys1Q78S06 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sys1Q78S06 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sys1Q78S06 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sys1Q78S06 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sys1Q78S06 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sys1Q78S06 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sys1Q78S06 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sys1Q78S06 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sys1Q78S06 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sys1Q78S06 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sys1Q78S06 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sys1Q78S06 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sys1Q78S06 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sys1Q78S06 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sys1Q78S06 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sys1Q78S06 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sys1Q78S06 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sys1Q78S06 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sys1Q78S06 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sys1Q78S06 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sys1Q78S06 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sys1Q78S06 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms