Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Higd1cQ76I25 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Higd1cQ76I25 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Higd1cQ76I25 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Higd1cQ76I25 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Higd1cQ76I25 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Higd1cQ76I25 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Higd1cQ76I25 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Higd1cQ76I25 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Higd1cQ76I25 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Higd1cQ76I25 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Higd1cQ76I25 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Higd1cQ76I25 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Higd1cQ76I25 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Higd1cQ76I25 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Higd1cQ76I25 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Higd1cQ76I25 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Higd1cQ76I25 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Higd1cQ76I25 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Higd1cQ76I25 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Higd1cQ76I25 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Higd1cQ76I25 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Higd1cQ76I25 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Higd1cQ76I25 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Higd1cQ76I25 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Higd1cQ76I25 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Higd1cQ76I25 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Higd1cQ76I25 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Higd1cQ76I25 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Higd1cQ76I25 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Higd1cQ76I25 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Higd1cQ76I25 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Higd1cQ76I25 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Higd1cQ76I25 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Higd1cQ76I25 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Higd1cQ76I25 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Higd1cQ76I25 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Higd1cQ76I25 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Higd1cQ76I25 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Higd1cQ76I25 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Higd1cQ76I25 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Higd1cQ76I25 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Higd1cQ76I25 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Higd1cQ76I25 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Higd1cQ76I25 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Higd1cQ76I25 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Higd1cQ76I25 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Higd1cQ76I25 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Higd1cQ76I25 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Higd1cQ76I25 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Higd1cQ76I25 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Higd1cQ76I25 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Higd1cQ76I25 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Higd1cQ76I25 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Higd1cQ76I25 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Higd1cQ76I25 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Higd1cQ76I25 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Higd1cQ76I25 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Higd1cQ76I25 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Higd1cQ76I25 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Higd1cQ76I25 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Higd1cQ76I25 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Higd1cQ76I25 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Higd1cQ76I25 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Higd1cQ76I25 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Higd1cQ76I25 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Higd1cQ76I25 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Higd1cQ76I25 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Higd1cQ76I25 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Higd1cQ76I25 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Higd1cQ76I25 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Higd1cQ76I25 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Higd1cQ76I25 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Higd1cQ76I25 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Higd1cQ76I25 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Higd1cQ76I25 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Higd1cQ76I25 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Higd1cQ76I25 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Higd1cQ76I25 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Higd1cQ76I25 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Higd1cQ76I25 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Higd1cQ76I25 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Higd1cQ76I25 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Higd1cQ76I25 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Higd1cQ76I25 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Higd1cQ76I25 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Higd1cQ76I25 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Higd1cQ76I25 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Higd1cQ76I25 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Higd1cQ76I25 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Higd1cQ76I25 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Higd1cQ76I25 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Higd1cQ76I25 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Higd1cQ76I25 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Higd1cQ76I25 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Higd1cQ76I25 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Higd1cQ76I25 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Higd1cQ76I25 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Higd1cQ76I25 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Higd1cQ76I25 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms