Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQH8

Nup188, Nucleoporin NUP188 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup188Q6ZQH8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nup188Q6ZQH8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nup188Q6ZQH8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nup188Q6ZQH8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nup188Q6ZQH8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nup188Q6ZQH8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nup188Q6ZQH8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nup188Q6ZQH8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nup188Q6ZQH8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nup188Q6ZQH8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nup188Q6ZQH8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nup188Q6ZQH8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nup188Q6ZQH8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nup188Q6ZQH8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nup188Q6ZQH8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nup188Q6ZQH8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nup188Q6ZQH8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nup188Q6ZQH8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nup188Q6ZQH8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nup188Q6ZQH8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nup188Q6ZQH8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nup188Q6ZQH8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nup188Q6ZQH8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nup188Q6ZQH8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nup188Q6ZQH8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nup188Q6ZQH8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nup188Q6ZQH8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nup188Q6ZQH8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nup188Q6ZQH8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nup188Q6ZQH8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nup188Q6ZQH8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nup188Q6ZQH8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nup188Q6ZQH8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nup188Q6ZQH8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nup188Q6ZQH8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nup188Q6ZQH8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nup188Q6ZQH8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nup188Q6ZQH8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nup188Q6ZQH8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nup188Q6ZQH8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Nup188Q6ZQH8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nup188Q6ZQH8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nup188Q6ZQH8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nup188Q6ZQH8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nup188Q6ZQH8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nup188Q6ZQH8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nup188Q6ZQH8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nup188Q6ZQH8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nup188Q6ZQH8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nup188Q6ZQH8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nup188Q6ZQH8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nup188Q6ZQH8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nup188Q6ZQH8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nup188Q6ZQH8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nup188Q6ZQH8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nup188Q6ZQH8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nup188Q6ZQH8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nup188Q6ZQH8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Nup188Q6ZQH8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nup188Q6ZQH8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nup188Q6ZQH8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nup188Q6ZQH8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nup188Q6ZQH8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Nup188Q6ZQH8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nup188Q6ZQH8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nup188Q6ZQH8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nup188Q6ZQH8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nup188Q6ZQH8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Nup188Q6ZQH8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nup188Q6ZQH8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nup188Q6ZQH8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nup188Q6ZQH8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nup188Q6ZQH8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nup188Q6ZQH8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nup188Q6ZQH8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nup188Q6ZQH8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nup188Q6ZQH8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Nup188Q6ZQH8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nup188Q6ZQH8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Nup188Q6ZQH8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nup188Q6ZQH8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nup188Q6ZQH8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nup188Q6ZQH8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nup188Q6ZQH8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nup188Q6ZQH8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nup188Q6ZQH8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nup188Q6ZQH8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nup188Q6ZQH8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nup188Q6ZQH8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nup188Q6ZQH8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nup188Q6ZQH8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nup188Q6ZQH8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nup188Q6ZQH8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nup188Q6ZQH8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Nup188Q6ZQH8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nup188Q6ZQH8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nup188Q6ZQH8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nup188Q6ZQH8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nup188Q6ZQH8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nup188Q6ZQH8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms