Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc88cQ6VGS5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc88cQ6VGS5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc88cQ6VGS5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc88cQ6VGS5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc88cQ6VGS5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc88cQ6VGS5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc88cQ6VGS5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc88cQ6VGS5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc88cQ6VGS5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc88cQ6VGS5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc88cQ6VGS5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc88cQ6VGS5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc88cQ6VGS5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc88cQ6VGS5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms