Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc57Q6PHN1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc57Q6PHN1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc57Q6PHN1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc57Q6PHN1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc57Q6PHN1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc57Q6PHN1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc57Q6PHN1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc57Q6PHN1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc57Q6PHN1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc57Q6PHN1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc57Q6PHN1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc57Q6PHN1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc57Q6PHN1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc57Q6PHN1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc57Q6PHN1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc57Q6PHN1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc57Q6PHN1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc57Q6PHN1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc57Q6PHN1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc57Q6PHN1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc57Q6PHN1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc57Q6PHN1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc57Q6PHN1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc57Q6PHN1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc57Q6PHN1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc57Q6PHN1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc57Q6PHN1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc57Q6PHN1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc57Q6PHN1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc57Q6PHN1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc57Q6PHN1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc57Q6PHN1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc57Q6PHN1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc57Q6PHN1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc57Q6PHN1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc57Q6PHN1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc57Q6PHN1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc57Q6PHN1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc57Q6PHN1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc57Q6PHN1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc57Q6PHN1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc57Q6PHN1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc57Q6PHN1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc57Q6PHN1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc57Q6PHN1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc57Q6PHN1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc57Q6PHN1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc57Q6PHN1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc57Q6PHN1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc57Q6PHN1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc57Q6PHN1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc57Q6PHN1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc57Q6PHN1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc57Q6PHN1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc57Q6PHN1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc57Q6PHN1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc57Q6PHN1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc57Q6PHN1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc57Q6PHN1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc57Q6PHN1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc57Q6PHN1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc57Q6PHN1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc57Q6PHN1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc57Q6PHN1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc57Q6PHN1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc57Q6PHN1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc57Q6PHN1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc57Q6PHN1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc57Q6PHN1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc57Q6PHN1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc57Q6PHN1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc57Q6PHN1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc57Q6PHN1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc57Q6PHN1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc57Q6PHN1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc57Q6PHN1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc57Q6PHN1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc57Q6PHN1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc57Q6PHN1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc57Q6PHN1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc57Q6PHN1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc57Q6PHN1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc57Q6PHN1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc57Q6PHN1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc57Q6PHN1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc57Q6PHN1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc57Q6PHN1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc57Q6PHN1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc57Q6PHN1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc57Q6PHN1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc57Q6PHN1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc57Q6PHN1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc57Q6PHN1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc57Q6PHN1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc57Q6PHN1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc57Q6PHN1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc57Q6PHN1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc57Q6PHN1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc57Q6PHN1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms