Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGE4

Znf316, Zinc finger protein 316, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf316Q6PGE4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Znf316Q6PGE4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Znf316Q6PGE4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Znf316Q6PGE4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Znf316Q6PGE4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Znf316Q6PGE4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Znf316Q6PGE4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Znf316Q6PGE4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Znf316Q6PGE4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Znf316Q6PGE4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Znf316Q6PGE4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Znf316Q6PGE4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Znf316Q6PGE4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Znf316Q6PGE4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Znf316Q6PGE4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Znf316Q6PGE4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Znf316Q6PGE4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Znf316Q6PGE4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Znf316Q6PGE4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Znf316Q6PGE4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Znf316Q6PGE4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Znf316Q6PGE4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Znf316Q6PGE4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Znf316Q6PGE4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Znf316Q6PGE4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Znf316Q6PGE4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Znf316Q6PGE4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Znf316Q6PGE4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Znf316Q6PGE4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Znf316Q6PGE4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Znf316Q6PGE4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Znf316Q6PGE4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Znf316Q6PGE4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Znf316Q6PGE4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Znf316Q6PGE4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Znf316Q6PGE4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Znf316Q6PGE4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Znf316Q6PGE4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Znf316Q6PGE4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Znf316Q6PGE4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Znf316Q6PGE4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Znf316Q6PGE4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Znf316Q6PGE4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Znf316Q6PGE4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Znf316Q6PGE4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Znf316Q6PGE4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Znf316Q6PGE4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Znf316Q6PGE4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Znf316Q6PGE4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Znf316Q6PGE4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Znf316Q6PGE4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Znf316Q6PGE4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Znf316Q6PGE4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Znf316Q6PGE4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Znf316Q6PGE4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Znf316Q6PGE4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Znf316Q6PGE4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Znf316Q6PGE4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Znf316Q6PGE4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Znf316Q6PGE4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Znf316Q6PGE4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Znf316Q6PGE4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Znf316Q6PGE4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Znf316Q6PGE4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Znf316Q6PGE4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Znf316Q6PGE4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Znf316Q6PGE4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Znf316Q6PGE4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Znf316Q6PGE4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Znf316Q6PGE4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Znf316Q6PGE4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Znf316Q6PGE4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Znf316Q6PGE4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Znf316Q6PGE4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Znf316Q6PGE4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Znf316Q6PGE4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Znf316Q6PGE4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Znf316Q6PGE4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Znf316Q6PGE4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Znf316Q6PGE4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Znf316Q6PGE4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Znf316Q6PGE4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Znf316Q6PGE4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Znf316Q6PGE4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Znf316Q6PGE4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Znf316Q6PGE4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Znf316Q6PGE4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Znf316Q6PGE4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Znf316Q6PGE4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Znf316Q6PGE4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Znf316Q6PGE4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Znf316Q6PGE4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Znf316Q6PGE4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Znf316Q6PGE4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Znf316Q6PGE4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Znf316Q6PGE4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Znf316Q6PGE4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Znf316Q6PGE4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Znf316Q6PGE4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Znf316Q6PGE4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms