Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS3

Sarm1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sarm1Q6PDS3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sarm1Q6PDS3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sarm1Q6PDS3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sarm1Q6PDS3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sarm1Q6PDS3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sarm1Q6PDS3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sarm1Q6PDS3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sarm1Q6PDS3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sarm1Q6PDS3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sarm1Q6PDS3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sarm1Q6PDS3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sarm1Q6PDS3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sarm1Q6PDS3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sarm1Q6PDS3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sarm1Q6PDS3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sarm1Q6PDS3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sarm1Q6PDS3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sarm1Q6PDS3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sarm1Q6PDS3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sarm1Q6PDS3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sarm1Q6PDS3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sarm1Q6PDS3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sarm1Q6PDS3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sarm1Q6PDS3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sarm1Q6PDS3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sarm1Q6PDS3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sarm1Q6PDS3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sarm1Q6PDS3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sarm1Q6PDS3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sarm1Q6PDS3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sarm1Q6PDS3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sarm1Q6PDS3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sarm1Q6PDS3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sarm1Q6PDS3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sarm1Q6PDS3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sarm1Q6PDS3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sarm1Q6PDS3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sarm1Q6PDS3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sarm1Q6PDS3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sarm1Q6PDS3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sarm1Q6PDS3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sarm1Q6PDS3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sarm1Q6PDS3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sarm1Q6PDS3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sarm1Q6PDS3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sarm1Q6PDS3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sarm1Q6PDS3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sarm1Q6PDS3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sarm1Q6PDS3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sarm1Q6PDS3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sarm1Q6PDS3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sarm1Q6PDS3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sarm1Q6PDS3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sarm1Q6PDS3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sarm1Q6PDS3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sarm1Q6PDS3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sarm1Q6PDS3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sarm1Q6PDS3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sarm1Q6PDS3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sarm1Q6PDS3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sarm1Q6PDS3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sarm1Q6PDS3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sarm1Q6PDS3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sarm1Q6PDS3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sarm1Q6PDS3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sarm1Q6PDS3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sarm1Q6PDS3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sarm1Q6PDS3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sarm1Q6PDS3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sarm1Q6PDS3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sarm1Q6PDS3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Sarm1Q6PDS3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sarm1Q6PDS3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sarm1Q6PDS3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sarm1Q6PDS3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sarm1Q6PDS3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sarm1Q6PDS3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sarm1Q6PDS3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sarm1Q6PDS3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sarm1Q6PDS3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sarm1Q6PDS3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sarm1Q6PDS3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Sarm1Q6PDS3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sarm1Q6PDS3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sarm1Q6PDS3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sarm1Q6PDS3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sarm1Q6PDS3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sarm1Q6PDS3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sarm1Q6PDS3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sarm1Q6PDS3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sarm1Q6PDS3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sarm1Q6PDS3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sarm1Q6PDS3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sarm1Q6PDS3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sarm1Q6PDS3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sarm1Q6PDS3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sarm1Q6PDS3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sarm1Q6PDS3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sarm1Q6PDS3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sarm1Q6PDS3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms