Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BC061212Q6P8K3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BC061212Q6P8K3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BC061212Q6P8K3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BC061212Q6P8K3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BC061212Q6P8K3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BC061212Q6P8K3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BC061212Q6P8K3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BC061212Q6P8K3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BC061212Q6P8K3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BC061212Q6P8K3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BC061212Q6P8K3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BC061212Q6P8K3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BC061212Q6P8K3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BC061212Q6P8K3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BC061212Q6P8K3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BC061212Q6P8K3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BC061212Q6P8K3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BC061212Q6P8K3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BC061212Q6P8K3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BC061212Q6P8K3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BC061212Q6P8K3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BC061212Q6P8K3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BC061212Q6P8K3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BC061212Q6P8K3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BC061212Q6P8K3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BC061212Q6P8K3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BC061212Q6P8K3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BC061212Q6P8K3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BC061212Q6P8K3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BC061212Q6P8K3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BC061212Q6P8K3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BC061212Q6P8K3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BC061212Q6P8K3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BC061212Q6P8K3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BC061212Q6P8K3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BC061212Q6P8K3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BC061212Q6P8K3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BC061212Q6P8K3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BC061212Q6P8K3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BC061212Q6P8K3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BC061212Q6P8K3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
BC061212Q6P8K3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BC061212Q6P8K3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BC061212Q6P8K3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BC061212Q6P8K3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BC061212Q6P8K3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BC061212Q6P8K3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BC061212Q6P8K3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BC061212Q6P8K3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BC061212Q6P8K3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BC061212Q6P8K3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BC061212Q6P8K3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BC061212Q6P8K3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BC061212Q6P8K3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BC061212Q6P8K3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BC061212Q6P8K3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BC061212Q6P8K3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BC061212Q6P8K3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BC061212Q6P8K3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BC061212Q6P8K3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BC061212Q6P8K3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BC061212Q6P8K3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BC061212Q6P8K3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BC061212Q6P8K3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BC061212Q6P8K3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BC061212Q6P8K3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BC061212Q6P8K3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BC061212Q6P8K3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BC061212Q6P8K3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BC061212Q6P8K3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BC061212Q6P8K3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BC061212Q6P8K3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BC061212Q6P8K3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BC061212Q6P8K3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BC061212Q6P8K3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BC061212Q6P8K3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BC061212Q6P8K3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BC061212Q6P8K3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BC061212Q6P8K3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BC061212Q6P8K3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BC061212Q6P8K3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BC061212Q6P8K3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BC061212Q6P8K3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BC061212Q6P8K3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BC061212Q6P8K3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BC061212Q6P8K3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BC061212Q6P8K3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BC061212Q6P8K3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BC061212Q6P8K3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BC061212Q6P8K3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BC061212Q6P8K3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BC061212Q6P8K3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BC061212Q6P8K3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BC061212Q6P8K3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BC061212Q6P8K3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BC061212Q6P8K3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BC061212Q6P8K3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BC061212Q6P8K3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BC061212Q6P8K3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms