Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U8

Ccdc148, Coiled-coil domain-containing protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc148Q6P5U8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc148Q6P5U8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc148Q6P5U8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc148Q6P5U8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc148Q6P5U8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc148Q6P5U8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc148Q6P5U8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc148Q6P5U8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc148Q6P5U8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc148Q6P5U8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc148Q6P5U8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc148Q6P5U8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc148Q6P5U8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc148Q6P5U8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc148Q6P5U8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc148Q6P5U8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc148Q6P5U8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc148Q6P5U8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc148Q6P5U8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc148Q6P5U8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc148Q6P5U8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc148Q6P5U8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc148Q6P5U8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc148Q6P5U8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc148Q6P5U8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc148Q6P5U8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc148Q6P5U8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc148Q6P5U8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc148Q6P5U8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc148Q6P5U8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc148Q6P5U8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc148Q6P5U8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc148Q6P5U8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc148Q6P5U8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc148Q6P5U8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc148Q6P5U8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc148Q6P5U8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc148Q6P5U8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc148Q6P5U8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc148Q6P5U8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc148Q6P5U8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc148Q6P5U8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc148Q6P5U8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc148Q6P5U8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc148Q6P5U8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc148Q6P5U8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc148Q6P5U8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc148Q6P5U8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc148Q6P5U8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc148Q6P5U8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc148Q6P5U8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc148Q6P5U8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc148Q6P5U8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc148Q6P5U8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc148Q6P5U8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc148Q6P5U8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc148Q6P5U8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc148Q6P5U8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc148Q6P5U8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc148Q6P5U8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc148Q6P5U8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc148Q6P5U8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc148Q6P5U8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc148Q6P5U8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc148Q6P5U8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc148Q6P5U8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc148Q6P5U8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc148Q6P5U8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc148Q6P5U8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc148Q6P5U8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc148Q6P5U8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc148Q6P5U8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc148Q6P5U8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc148Q6P5U8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc148Q6P5U8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc148Q6P5U8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc148Q6P5U8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc148Q6P5U8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc148Q6P5U8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc148Q6P5U8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc148Q6P5U8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc148Q6P5U8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc148Q6P5U8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc148Q6P5U8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc148Q6P5U8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc148Q6P5U8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc148Q6P5U8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc148Q6P5U8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc148Q6P5U8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc148Q6P5U8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc148Q6P5U8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc148Q6P5U8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc148Q6P5U8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc148Q6P5U8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc148Q6P5U8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc148Q6P5U8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc148Q6P5U8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc148Q6P5U8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc148Q6P5U8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc148Q6P5U8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms