Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gpbp1l1Q6NZP2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gpbp1l1Q6NZP2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Gpbp1l1Q6NZP2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gpbp1l1Q6NZP2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gpbp1l1Q6NZP2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gpbp1l1Q6NZP2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gpbp1l1Q6NZP2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gpbp1l1Q6NZP2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gpbp1l1Q6NZP2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gpbp1l1Q6NZP2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms