Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rprd2Q6NXI6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Rprd2Q6NXI6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rprd2Q6NXI6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rprd2Q6NXI6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rprd2Q6NXI6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rprd2Q6NXI6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rprd2Q6NXI6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rprd2Q6NXI6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rprd2Q6NXI6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rprd2Q6NXI6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Rprd2Q6NXI6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rprd2Q6NXI6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Rprd2Q6NXI6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rprd2Q6NXI6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rprd2Q6NXI6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rprd2Q6NXI6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rprd2Q6NXI6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rprd2Q6NXI6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rprd2Q6NXI6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rprd2Q6NXI6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rprd2Q6NXI6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rprd2Q6NXI6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rprd2Q6NXI6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rprd2Q6NXI6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rprd2Q6NXI6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rprd2Q6NXI6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rprd2Q6NXI6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rprd2Q6NXI6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rprd2Q6NXI6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rprd2Q6NXI6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rprd2Q6NXI6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rprd2Q6NXI6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rprd2Q6NXI6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rprd2Q6NXI6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Rprd2Q6NXI6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rprd2Q6NXI6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rprd2Q6NXI6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rprd2Q6NXI6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rprd2Q6NXI6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rprd2Q6NXI6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rprd2Q6NXI6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rprd2Q6NXI6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rprd2Q6NXI6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rprd2Q6NXI6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rprd2Q6NXI6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rprd2Q6NXI6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rprd2Q6NXI6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rprd2Q6NXI6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rprd2Q6NXI6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rprd2Q6NXI6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rprd2Q6NXI6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rprd2Q6NXI6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rprd2Q6NXI6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rprd2Q6NXI6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rprd2Q6NXI6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rprd2Q6NXI6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rprd2Q6NXI6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rprd2Q6NXI6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rprd2Q6NXI6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rprd2Q6NXI6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rprd2Q6NXI6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rprd2Q6NXI6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rprd2Q6NXI6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rprd2Q6NXI6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rprd2Q6NXI6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rprd2Q6NXI6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rprd2Q6NXI6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Rprd2Q6NXI6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rprd2Q6NXI6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rprd2Q6NXI6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rprd2Q6NXI6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Rprd2Q6NXI6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rprd2Q6NXI6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rprd2Q6NXI6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rprd2Q6NXI6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rprd2Q6NXI6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rprd2Q6NXI6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rprd2Q6NXI6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rprd2Q6NXI6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rprd2Q6NXI6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rprd2Q6NXI6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rprd2Q6NXI6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Rprd2Q6NXI6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Rprd2Q6NXI6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Rprd2Q6NXI6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rprd2Q6NXI6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rprd2Q6NXI6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rprd2Q6NXI6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Rprd2Q6NXI6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rprd2Q6NXI6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rprd2Q6NXI6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Rprd2Q6NXI6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rprd2Q6NXI6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rprd2Q6NXI6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rprd2Q6NXI6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rprd2Q6NXI6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rprd2Q6NXI6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rprd2Q6NXI6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Rprd2Q6NXI6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms