Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZZ6

Tmcc1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc1Q69ZZ6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmcc1Q69ZZ6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmcc1Q69ZZ6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmcc1Q69ZZ6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmcc1Q69ZZ6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmcc1Q69ZZ6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmcc1Q69ZZ6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmcc1Q69ZZ6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmcc1Q69ZZ6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmcc1Q69ZZ6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmcc1Q69ZZ6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmcc1Q69ZZ6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmcc1Q69ZZ6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmcc1Q69ZZ6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmcc1Q69ZZ6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmcc1Q69ZZ6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmcc1Q69ZZ6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tmcc1Q69ZZ6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmcc1Q69ZZ6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmcc1Q69ZZ6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmcc1Q69ZZ6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmcc1Q69ZZ6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmcc1Q69ZZ6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmcc1Q69ZZ6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmcc1Q69ZZ6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmcc1Q69ZZ6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmcc1Q69ZZ6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmcc1Q69ZZ6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmcc1Q69ZZ6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmcc1Q69ZZ6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmcc1Q69ZZ6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmcc1Q69ZZ6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmcc1Q69ZZ6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmcc1Q69ZZ6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmcc1Q69ZZ6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmcc1Q69ZZ6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmcc1Q69ZZ6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmcc1Q69ZZ6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmcc1Q69ZZ6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmcc1Q69ZZ6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmcc1Q69ZZ6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmcc1Q69ZZ6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmcc1Q69ZZ6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmcc1Q69ZZ6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmcc1Q69ZZ6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmcc1Q69ZZ6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmcc1Q69ZZ6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmcc1Q69ZZ6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmcc1Q69ZZ6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmcc1Q69ZZ6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmcc1Q69ZZ6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmcc1Q69ZZ6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmcc1Q69ZZ6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmcc1Q69ZZ6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmcc1Q69ZZ6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmcc1Q69ZZ6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmcc1Q69ZZ6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmcc1Q69ZZ6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmcc1Q69ZZ6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmcc1Q69ZZ6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmcc1Q69ZZ6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmcc1Q69ZZ6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmcc1Q69ZZ6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmcc1Q69ZZ6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmcc1Q69ZZ6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmcc1Q69ZZ6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmcc1Q69ZZ6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmcc1Q69ZZ6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmcc1Q69ZZ6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmcc1Q69ZZ6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmcc1Q69ZZ6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmcc1Q69ZZ6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmcc1Q69ZZ6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmcc1Q69ZZ6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmcc1Q69ZZ6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmcc1Q69ZZ6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmcc1Q69ZZ6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmcc1Q69ZZ6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmcc1Q69ZZ6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmcc1Q69ZZ6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmcc1Q69ZZ6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmcc1Q69ZZ6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmcc1Q69ZZ6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmcc1Q69ZZ6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmcc1Q69ZZ6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmcc1Q69ZZ6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmcc1Q69ZZ6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmcc1Q69ZZ6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmcc1Q69ZZ6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmcc1Q69ZZ6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmcc1Q69ZZ6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmcc1Q69ZZ6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmcc1Q69ZZ6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmcc1Q69ZZ6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmcc1Q69ZZ6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmcc1Q69ZZ6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmcc1Q69ZZ6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmcc1Q69ZZ6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmcc1Q69ZZ6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmcc1Q69ZZ6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms