Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sbno1Q689Z5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sbno1Q689Z5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sbno1Q689Z5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sbno1Q689Z5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sbno1Q689Z5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sbno1Q689Z5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sbno1Q689Z5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sbno1Q689Z5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sbno1Q689Z5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sbno1Q689Z5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sbno1Q689Z5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sbno1Q689Z5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sbno1Q689Z5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sbno1Q689Z5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sbno1Q689Z5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sbno1Q689Z5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sbno1Q689Z5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Sbno1Q689Z5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sbno1Q689Z5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sbno1Q689Z5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sbno1Q689Z5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sbno1Q689Z5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sbno1Q689Z5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sbno1Q689Z5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sbno1Q689Z5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sbno1Q689Z5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sbno1Q689Z5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sbno1Q689Z5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sbno1Q689Z5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sbno1Q689Z5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sbno1Q689Z5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sbno1Q689Z5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sbno1Q689Z5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sbno1Q689Z5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sbno1Q689Z5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Sbno1Q689Z5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sbno1Q689Z5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sbno1Q689Z5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sbno1Q689Z5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Sbno1Q689Z5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Sbno1Q689Z5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Sbno1Q689Z5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sbno1Q689Z5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sbno1Q689Z5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sbno1Q689Z5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sbno1Q689Z5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sbno1Q689Z5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sbno1Q689Z5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sbno1Q689Z5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sbno1Q689Z5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sbno1Q689Z5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sbno1Q689Z5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sbno1Q689Z5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sbno1Q689Z5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sbno1Q689Z5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sbno1Q689Z5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sbno1Q689Z5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sbno1Q689Z5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sbno1Q689Z5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sbno1Q689Z5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sbno1Q689Z5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sbno1Q689Z5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sbno1Q689Z5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sbno1Q689Z5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sbno1Q689Z5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sbno1Q689Z5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sbno1Q689Z5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sbno1Q689Z5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sbno1Q689Z5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sbno1Q689Z5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sbno1Q689Z5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sbno1Q689Z5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sbno1Q689Z5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sbno1Q689Z5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sbno1Q689Z5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Sbno1Q689Z5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Sbno1Q689Z5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sbno1Q689Z5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sbno1Q689Z5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sbno1Q689Z5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sbno1Q689Z5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sbno1Q689Z5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sbno1Q689Z5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sbno1Q689Z5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Sbno1Q689Z5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Sbno1Q689Z5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sbno1Q689Z5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sbno1Q689Z5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sbno1Q689Z5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sbno1Q689Z5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sbno1Q689Z5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sbno1Q689Z5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sbno1Q689Z5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sbno1Q689Z5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sbno1Q689Z5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sbno1Q689Z5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sbno1Q689Z5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sbno1Q689Z5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sbno1Q689Z5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms