Protein–RNA interactions for Protein: Q66K08

Cilp, Cartilage intermediate layer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CilpQ66K08 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CilpQ66K08 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CilpQ66K08 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CilpQ66K08 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CilpQ66K08 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CilpQ66K08 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CilpQ66K08 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CilpQ66K08 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CilpQ66K08 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CilpQ66K08 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CilpQ66K08 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CilpQ66K08 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CilpQ66K08 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CilpQ66K08 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CilpQ66K08 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CilpQ66K08 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CilpQ66K08 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CilpQ66K08 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CilpQ66K08 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CilpQ66K08 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CilpQ66K08 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CilpQ66K08 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CilpQ66K08 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CilpQ66K08 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CilpQ66K08 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CilpQ66K08 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CilpQ66K08 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CilpQ66K08 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CilpQ66K08 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CilpQ66K08 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CilpQ66K08 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CilpQ66K08 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CilpQ66K08 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CilpQ66K08 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CilpQ66K08 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CilpQ66K08 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CilpQ66K08 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CilpQ66K08 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CilpQ66K08 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CilpQ66K08 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CilpQ66K08 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CilpQ66K08 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CilpQ66K08 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CilpQ66K08 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CilpQ66K08 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CilpQ66K08 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CilpQ66K08 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CilpQ66K08 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CilpQ66K08 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CilpQ66K08 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CilpQ66K08 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CilpQ66K08 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CilpQ66K08 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CilpQ66K08 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CilpQ66K08 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CilpQ66K08 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CilpQ66K08 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CilpQ66K08 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CilpQ66K08 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CilpQ66K08 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CilpQ66K08 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CilpQ66K08 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CilpQ66K08 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CilpQ66K08 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CilpQ66K08 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CilpQ66K08 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CilpQ66K08 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CilpQ66K08 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CilpQ66K08 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CilpQ66K08 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CilpQ66K08 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CilpQ66K08 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CilpQ66K08 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CilpQ66K08 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CilpQ66K08 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CilpQ66K08 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CilpQ66K08 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CilpQ66K08 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CilpQ66K08 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CilpQ66K08 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CilpQ66K08 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CilpQ66K08 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CilpQ66K08 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CilpQ66K08 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CilpQ66K08 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CilpQ66K08 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CilpQ66K08 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CilpQ66K08 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CilpQ66K08 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CilpQ66K08 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CilpQ66K08 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CilpQ66K08 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CilpQ66K08 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CilpQ66K08 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CilpQ66K08 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CilpQ66K08 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CilpQ66K08 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CilpQ66K08 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CilpQ66K08 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CilpQ66K08 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms