Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY2

Ino80d, INO80 complex subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80dQ66JY2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ino80dQ66JY2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ino80dQ66JY2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ino80dQ66JY2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ino80dQ66JY2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ino80dQ66JY2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ino80dQ66JY2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ino80dQ66JY2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ino80dQ66JY2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ino80dQ66JY2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ino80dQ66JY2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ino80dQ66JY2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ino80dQ66JY2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ino80dQ66JY2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ino80dQ66JY2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ino80dQ66JY2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ino80dQ66JY2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ino80dQ66JY2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ino80dQ66JY2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ino80dQ66JY2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ino80dQ66JY2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ino80dQ66JY2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ino80dQ66JY2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ino80dQ66JY2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ino80dQ66JY2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ino80dQ66JY2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ino80dQ66JY2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ino80dQ66JY2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ino80dQ66JY2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ino80dQ66JY2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ino80dQ66JY2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ino80dQ66JY2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ino80dQ66JY2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ino80dQ66JY2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ino80dQ66JY2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ino80dQ66JY2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ino80dQ66JY2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ino80dQ66JY2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ino80dQ66JY2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ino80dQ66JY2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ino80dQ66JY2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ino80dQ66JY2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ino80dQ66JY2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ino80dQ66JY2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ino80dQ66JY2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ino80dQ66JY2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ino80dQ66JY2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ino80dQ66JY2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ino80dQ66JY2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ino80dQ66JY2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ino80dQ66JY2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ino80dQ66JY2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ino80dQ66JY2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ino80dQ66JY2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ino80dQ66JY2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ino80dQ66JY2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ino80dQ66JY2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ino80dQ66JY2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ino80dQ66JY2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ino80dQ66JY2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ino80dQ66JY2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ino80dQ66JY2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ino80dQ66JY2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ino80dQ66JY2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ino80dQ66JY2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ino80dQ66JY2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ino80dQ66JY2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ino80dQ66JY2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ino80dQ66JY2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ino80dQ66JY2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ino80dQ66JY2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ino80dQ66JY2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ino80dQ66JY2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ino80dQ66JY2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ino80dQ66JY2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ino80dQ66JY2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ino80dQ66JY2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ino80dQ66JY2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ino80dQ66JY2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ino80dQ66JY2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ino80dQ66JY2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ino80dQ66JY2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ino80dQ66JY2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ino80dQ66JY2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ino80dQ66JY2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ino80dQ66JY2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ino80dQ66JY2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ino80dQ66JY2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ino80dQ66JY2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ino80dQ66JY2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ino80dQ66JY2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ino80dQ66JY2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ino80dQ66JY2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ino80dQ66JY2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ino80dQ66JY2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ino80dQ66JY2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ino80dQ66JY2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ino80dQ66JY2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ino80dQ66JY2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ino80dQ66JY2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms