Protein–RNA interactions for Protein: Q64364

Cdkn2a, Tumor suppressor ARF, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2aQ64364 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn2aQ64364 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn2aQ64364 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn2aQ64364 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn2aQ64364 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn2aQ64364 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn2aQ64364 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn2aQ64364 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn2aQ64364 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn2aQ64364 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn2aQ64364 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn2aQ64364 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn2aQ64364 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn2aQ64364 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn2aQ64364 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn2aQ64364 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn2aQ64364 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn2aQ64364 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn2aQ64364 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn2aQ64364 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn2aQ64364 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn2aQ64364 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn2aQ64364 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn2aQ64364 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn2aQ64364 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn2aQ64364 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn2aQ64364 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn2aQ64364 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn2aQ64364 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn2aQ64364 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2aQ64364 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2aQ64364 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2aQ64364 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2aQ64364 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2aQ64364 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2aQ64364 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2aQ64364 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2aQ64364 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2aQ64364 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2aQ64364 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn2aQ64364 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn2aQ64364 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn2aQ64364 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn2aQ64364 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn2aQ64364 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn2aQ64364 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn2aQ64364 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn2aQ64364 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn2aQ64364 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn2aQ64364 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn2aQ64364 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn2aQ64364 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkn2aQ64364 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkn2aQ64364 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkn2aQ64364 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkn2aQ64364 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkn2aQ64364 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkn2aQ64364 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cdkn2aQ64364 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn2aQ64364 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn2aQ64364 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn2aQ64364 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn2aQ64364 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn2aQ64364 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn2aQ64364 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn2aQ64364 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn2aQ64364 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn2aQ64364 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn2aQ64364 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn2aQ64364 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn2aQ64364 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn2aQ64364 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn2aQ64364 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn2aQ64364 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn2aQ64364 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn2aQ64364 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn2aQ64364 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn2aQ64364 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn2aQ64364 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkn2aQ64364 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkn2aQ64364 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkn2aQ64364 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkn2aQ64364 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkn2aQ64364 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkn2aQ64364 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkn2aQ64364 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkn2aQ64364 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkn2aQ64364 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkn2aQ64364 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkn2aQ64364 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkn2aQ64364 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkn2aQ64364 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkn2aQ64364 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkn2aQ64364 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkn2aQ64364 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkn2aQ64364 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkn2aQ64364 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkn2aQ64364 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkn2aQ64364 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkn2aQ64364 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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