Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col4a5Q63ZW6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col4a5Q63ZW6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Col4a5Q63ZW6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Col4a5Q63ZW6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Col4a5Q63ZW6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Col4a5Q63ZW6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Col4a5Q63ZW6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Col4a5Q63ZW6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Col4a5Q63ZW6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Col4a5Q63ZW6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col4a5Q63ZW6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col4a5Q63ZW6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col4a5Q63ZW6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Col4a5Q63ZW6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col4a5Q63ZW6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Col4a5Q63ZW6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col4a5Q63ZW6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col4a5Q63ZW6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col4a5Q63ZW6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col4a5Q63ZW6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col4a5Q63ZW6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Col4a5Q63ZW6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Col4a5Q63ZW6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col4a5Q63ZW6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col4a5Q63ZW6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col4a5Q63ZW6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col4a5Q63ZW6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col4a5Q63ZW6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col4a5Q63ZW6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col4a5Q63ZW6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col4a5Q63ZW6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col4a5Q63ZW6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col4a5Q63ZW6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col4a5Q63ZW6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col4a5Q63ZW6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col4a5Q63ZW6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col4a5Q63ZW6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col4a5Q63ZW6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col4a5Q63ZW6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col4a5Q63ZW6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col4a5Q63ZW6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Col4a5Q63ZW6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Col4a5Q63ZW6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Col4a5Q63ZW6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Col4a5Q63ZW6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Col4a5Q63ZW6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Col4a5Q63ZW6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Col4a5Q63ZW6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Col4a5Q63ZW6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col4a5Q63ZW6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col4a5Q63ZW6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col4a5Q63ZW6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col4a5Q63ZW6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Col4a5Q63ZW6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col4a5Q63ZW6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col4a5Q63ZW6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col4a5Q63ZW6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Col4a5Q63ZW6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col4a5Q63ZW6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col4a5Q63ZW6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col4a5Q63ZW6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col4a5Q63ZW6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col4a5Q63ZW6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col4a5Q63ZW6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col4a5Q63ZW6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col4a5Q63ZW6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Col4a5Q63ZW6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col4a5Q63ZW6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col4a5Q63ZW6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col4a5Q63ZW6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col4a5Q63ZW6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col4a5Q63ZW6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col4a5Q63ZW6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col4a5Q63ZW6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col4a5Q63ZW6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col4a5Q63ZW6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col4a5Q63ZW6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col4a5Q63ZW6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Col4a5Q63ZW6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col4a5Q63ZW6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col4a5Q63ZW6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Col4a5Q63ZW6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Col4a5Q63ZW6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Col4a5Q63ZW6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Col4a5Q63ZW6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Col4a5Q63ZW6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Col4a5Q63ZW6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Col4a5Q63ZW6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Col4a5Q63ZW6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Col4a5Q63ZW6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Col4a5Q63ZW6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col4a5Q63ZW6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col4a5Q63ZW6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Col4a5Q63ZW6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col4a5Q63ZW6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Col4a5Q63ZW6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col4a5Q63ZW6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col4a5Q63ZW6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Col4a5Q63ZW6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms