Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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Ttf1Q62187 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ttf1Q62187 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ttf1Q62187 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ttf1Q62187 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ttf1Q62187 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ttf1Q62187 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ttf1Q62187 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ttf1Q62187 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ttf1Q62187 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ttf1Q62187 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ttf1Q62187 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ttf1Q62187 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ttf1Q62187 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ttf1Q62187 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ttf1Q62187 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ttf1Q62187 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ttf1Q62187 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ttf1Q62187 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ttf1Q62187 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ttf1Q62187 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ttf1Q62187 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ttf1Q62187 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ttf1Q62187 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ttf1Q62187 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ttf1Q62187 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ttf1Q62187 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Ttf1Q62187 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttf1Q62187 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttf1Q62187 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttf1Q62187 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttf1Q62187 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttf1Q62187 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttf1Q62187 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttf1Q62187 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttf1Q62187 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttf1Q62187 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttf1Q62187 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttf1Q62187 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttf1Q62187 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Ttf1Q62187 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttf1Q62187 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttf1Q62187 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttf1Q62187 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttf1Q62187 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttf1Q62187 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttf1Q62187 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttf1Q62187 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Ttf1Q62187 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ttf1Q62187 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ttf1Q62187 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttf1Q62187 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Ttf1Q62187 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Ttf1Q62187 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Ttf1Q62187 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttf1Q62187 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttf1Q62187 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttf1Q62187 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttf1Q62187 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttf1Q62187 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttf1Q62187 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttf1Q62187 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttf1Q62187 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttf1Q62187 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttf1Q62187 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttf1Q62187 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttf1Q62187 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttf1Q62187 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttf1Q62187 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttf1Q62187 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttf1Q62187 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttf1Q62187 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ttf1Q62187 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ttf1Q62187 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ttf1Q62187 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ttf1Q62187 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ttf1Q62187 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ttf1Q62187 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ttf1Q62187 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms