Protein–RNA interactions for Protein: Q61501

E2f1, Transcription factor E2F1, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f1Q61501 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
E2f1Q61501 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
E2f1Q61501 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
E2f1Q61501 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2f1Q61501 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2f1Q61501 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2f1Q61501 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2f1Q61501 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2f1Q61501 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2f1Q61501 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2f1Q61501 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2f1Q61501 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
E2f1Q61501 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2f1Q61501 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2f1Q61501 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2f1Q61501 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
E2f1Q61501 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.7
E2f1Q61501 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
E2f1Q61501 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2f1Q61501 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2f1Q61501 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2f1Q61501 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2f1Q61501 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2f1Q61501 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2f1Q61501 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2f1Q61501 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
E2f1Q61501 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2f1Q61501 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2f1Q61501 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2f1Q61501 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2f1Q61501 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2f1Q61501 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2f1Q61501 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2f1Q61501 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2f1Q61501 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2f1Q61501 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
E2f1Q61501 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
E2f1Q61501 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2f1Q61501 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2f1Q61501 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2f1Q61501 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2f1Q61501 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
E2f1Q61501 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2f1Q61501 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2f1Q61501 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2f1Q61501 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2f1Q61501 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2f1Q61501 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2f1Q61501 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2f1Q61501 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
E2f1Q61501 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2f1Q61501 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2f1Q61501 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2f1Q61501 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2f1Q61501 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2f1Q61501 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
E2f1Q61501 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
E2f1Q61501 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2f1Q61501 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
E2f1Q61501 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
E2f1Q61501 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
E2f1Q61501 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
E2f1Q61501 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
E2f1Q61501 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
E2f1Q61501 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
E2f1Q61501 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
E2f1Q61501 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
E2f1Q61501 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2f1Q61501 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2f1Q61501 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2f1Q61501 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
E2f1Q61501 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2f1Q61501 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2f1Q61501 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2f1Q61501 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2f1Q61501 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2f1Q61501 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2f1Q61501 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2f1Q61501 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2f1Q61501 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2f1Q61501 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2f1Q61501 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
E2f1Q61501 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2f1Q61501 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2f1Q61501 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2f1Q61501 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2f1Q61501 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2f1Q61501 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2f1Q61501 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2f1Q61501 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2f1Q61501 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2f1Q61501 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
E2f1Q61501 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2f1Q61501 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2f1Q61501 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2f1Q61501 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
E2f1Q61501 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2f1Q61501 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2f1Q61501 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2f1Q61501 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms