Protein–RNA interactions for Protein: Q61271

Acvr1b, Activin receptor type-1B, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acvr1bQ61271 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Acvr1bQ61271 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Acvr1bQ61271 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Acvr1bQ61271 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Acvr1bQ61271 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Acvr1bQ61271 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Acvr1bQ61271 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Acvr1bQ61271 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Acvr1bQ61271 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Acvr1bQ61271 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Acvr1bQ61271 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Acvr1bQ61271 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Acvr1bQ61271 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Acvr1bQ61271 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Acvr1bQ61271 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Acvr1bQ61271 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Acvr1bQ61271 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Acvr1bQ61271 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Acvr1bQ61271 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Acvr1bQ61271 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Acvr1bQ61271 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Acvr1bQ61271 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Acvr1bQ61271 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Acvr1bQ61271 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Acvr1bQ61271 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Acvr1bQ61271 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Acvr1bQ61271 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Acvr1bQ61271 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Acvr1bQ61271 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Acvr1bQ61271 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Acvr1bQ61271 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Acvr1bQ61271 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Acvr1bQ61271 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Acvr1bQ61271 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Acvr1bQ61271 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Acvr1bQ61271 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Acvr1bQ61271 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Acvr1bQ61271 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Acvr1bQ61271 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Acvr1bQ61271 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Acvr1bQ61271 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Acvr1bQ61271 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Acvr1bQ61271 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Acvr1bQ61271 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Acvr1bQ61271 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Acvr1bQ61271 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Acvr1bQ61271 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Acvr1bQ61271 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Acvr1bQ61271 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Acvr1bQ61271 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Acvr1bQ61271 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Acvr1bQ61271 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Acvr1bQ61271 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Acvr1bQ61271 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Acvr1bQ61271 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Acvr1bQ61271 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Acvr1bQ61271 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Acvr1bQ61271 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Acvr1bQ61271 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Acvr1bQ61271 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Acvr1bQ61271 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Acvr1bQ61271 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Acvr1bQ61271 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Acvr1bQ61271 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Acvr1bQ61271 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Acvr1bQ61271 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Acvr1bQ61271 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Acvr1bQ61271 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Acvr1bQ61271 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Acvr1bQ61271 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Acvr1bQ61271 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Acvr1bQ61271 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Acvr1bQ61271 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Acvr1bQ61271 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Acvr1bQ61271 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Acvr1bQ61271 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Acvr1bQ61271 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Acvr1bQ61271 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Acvr1bQ61271 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Acvr1bQ61271 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Acvr1bQ61271 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Acvr1bQ61271 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Acvr1bQ61271 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Acvr1bQ61271 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Acvr1bQ61271 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Acvr1bQ61271 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Acvr1bQ61271 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Acvr1bQ61271 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Acvr1bQ61271 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Acvr1bQ61271 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Acvr1bQ61271 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Acvr1bQ61271 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Acvr1bQ61271 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Acvr1bQ61271 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Acvr1bQ61271 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Acvr1bQ61271 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Acvr1bQ61271 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Acvr1bQ61271 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Acvr1bQ61271 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Acvr1bQ61271 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms