Protein–RNA interactions for Protein: Q60961

Laptm4a, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Laptm4aQ60961 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Laptm4aQ60961 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Laptm4aQ60961 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Laptm4aQ60961 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Laptm4aQ60961 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Laptm4aQ60961 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Laptm4aQ60961 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Laptm4aQ60961 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Laptm4aQ60961 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Laptm4aQ60961 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Laptm4aQ60961 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Laptm4aQ60961 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Laptm4aQ60961 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Laptm4aQ60961 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Laptm4aQ60961 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Laptm4aQ60961 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Laptm4aQ60961 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Laptm4aQ60961 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Laptm4aQ60961 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Laptm4aQ60961 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Laptm4aQ60961 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Laptm4aQ60961 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Laptm4aQ60961 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Laptm4aQ60961 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Laptm4aQ60961 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Laptm4aQ60961 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Laptm4aQ60961 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Laptm4aQ60961 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Laptm4aQ60961 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Laptm4aQ60961 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Laptm4aQ60961 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Laptm4aQ60961 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Laptm4aQ60961 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Laptm4aQ60961 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Laptm4aQ60961 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Laptm4aQ60961 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Laptm4aQ60961 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Laptm4aQ60961 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Laptm4aQ60961 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Laptm4aQ60961 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Laptm4aQ60961 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Laptm4aQ60961 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Laptm4aQ60961 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Laptm4aQ60961 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Laptm4aQ60961 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Laptm4aQ60961 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Laptm4aQ60961 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Laptm4aQ60961 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Laptm4aQ60961 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Laptm4aQ60961 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Laptm4aQ60961 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Laptm4aQ60961 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Laptm4aQ60961 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Laptm4aQ60961 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Laptm4aQ60961 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Laptm4aQ60961 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Laptm4aQ60961 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Laptm4aQ60961 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Laptm4aQ60961 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Laptm4aQ60961 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Laptm4aQ60961 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Laptm4aQ60961 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Laptm4aQ60961 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Laptm4aQ60961 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Laptm4aQ60961 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Laptm4aQ60961 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Laptm4aQ60961 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Laptm4aQ60961 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Laptm4aQ60961 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Laptm4aQ60961 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Laptm4aQ60961 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Laptm4aQ60961 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Laptm4aQ60961 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Laptm4aQ60961 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Laptm4aQ60961 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Laptm4aQ60961 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Laptm4aQ60961 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Laptm4aQ60961 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Laptm4aQ60961 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Laptm4aQ60961 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Laptm4aQ60961 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Laptm4aQ60961 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Laptm4aQ60961 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Laptm4aQ60961 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Laptm4aQ60961 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Laptm4aQ60961 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Laptm4aQ60961 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Laptm4aQ60961 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Laptm4aQ60961 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Laptm4aQ60961 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Laptm4aQ60961 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Laptm4aQ60961 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Laptm4aQ60961 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Laptm4aQ60961 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Laptm4aQ60961 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Laptm4aQ60961 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Laptm4aQ60961 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Laptm4aQ60961 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Laptm4aQ60961 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Laptm4aQ60961 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms