Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPW0

Vps54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps54Q5SPW0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vps54Q5SPW0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vps54Q5SPW0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vps54Q5SPW0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vps54Q5SPW0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vps54Q5SPW0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Vps54Q5SPW0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vps54Q5SPW0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vps54Q5SPW0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vps54Q5SPW0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vps54Q5SPW0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Vps54Q5SPW0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vps54Q5SPW0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vps54Q5SPW0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vps54Q5SPW0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vps54Q5SPW0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vps54Q5SPW0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vps54Q5SPW0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Vps54Q5SPW0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vps54Q5SPW0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vps54Q5SPW0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vps54Q5SPW0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vps54Q5SPW0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vps54Q5SPW0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vps54Q5SPW0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vps54Q5SPW0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vps54Q5SPW0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vps54Q5SPW0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Vps54Q5SPW0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vps54Q5SPW0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vps54Q5SPW0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vps54Q5SPW0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vps54Q5SPW0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vps54Q5SPW0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vps54Q5SPW0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vps54Q5SPW0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vps54Q5SPW0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vps54Q5SPW0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vps54Q5SPW0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Vps54Q5SPW0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vps54Q5SPW0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vps54Q5SPW0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vps54Q5SPW0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vps54Q5SPW0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vps54Q5SPW0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vps54Q5SPW0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vps54Q5SPW0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vps54Q5SPW0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vps54Q5SPW0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vps54Q5SPW0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vps54Q5SPW0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vps54Q5SPW0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vps54Q5SPW0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vps54Q5SPW0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vps54Q5SPW0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vps54Q5SPW0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vps54Q5SPW0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vps54Q5SPW0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Vps54Q5SPW0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Vps54Q5SPW0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vps54Q5SPW0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vps54Q5SPW0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vps54Q5SPW0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vps54Q5SPW0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vps54Q5SPW0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vps54Q5SPW0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vps54Q5SPW0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vps54Q5SPW0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vps54Q5SPW0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vps54Q5SPW0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vps54Q5SPW0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vps54Q5SPW0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vps54Q5SPW0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Vps54Q5SPW0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vps54Q5SPW0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vps54Q5SPW0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vps54Q5SPW0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vps54Q5SPW0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vps54Q5SPW0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vps54Q5SPW0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vps54Q5SPW0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vps54Q5SPW0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vps54Q5SPW0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vps54Q5SPW0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vps54Q5SPW0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vps54Q5SPW0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vps54Q5SPW0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vps54Q5SPW0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vps54Q5SPW0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vps54Q5SPW0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vps54Q5SPW0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vps54Q5SPW0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vps54Q5SPW0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vps54Q5SPW0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vps54Q5SPW0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vps54Q5SPW0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vps54Q5SPW0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vps54Q5SPW0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vps54Q5SPW0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vps54Q5SPW0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms