Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBG8

Uncharacterized protein C1orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5EBG8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q5EBG8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q5EBG8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q5EBG8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q5EBG8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q5EBG8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q5EBG8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Q5EBG8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Q5EBG8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Q5EBG8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q5EBG8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q5EBG8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Q5EBG8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Q5EBG8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q5EBG8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q5EBG8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q5EBG8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Q5EBG8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Q5EBG8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q5EBG8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q5EBG8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q5EBG8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q5EBG8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q5EBG8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q5EBG8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q5EBG8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q5EBG8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q5EBG8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q5EBG8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q5EBG8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q5EBG8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q5EBG8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q5EBG8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q5EBG8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q5EBG8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q5EBG8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q5EBG8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q5EBG8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q5EBG8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q5EBG8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q5EBG8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q5EBG8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q5EBG8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q5EBG8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q5EBG8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q5EBG8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q5EBG8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q5EBG8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q5EBG8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q5EBG8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q5EBG8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q5EBG8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q5EBG8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q5EBG8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q5EBG8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Q5EBG8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q5EBG8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q5EBG8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q5EBG8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q5EBG8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q5EBG8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q5EBG8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q5EBG8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q5EBG8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q5EBG8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q5EBG8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q5EBG8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q5EBG8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q5EBG8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q5EBG8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q5EBG8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q5EBG8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q5EBG8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q5EBG8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Q5EBG8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q5EBG8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q5EBG8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q5EBG8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q5EBG8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q5EBG8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q5EBG8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q5EBG8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q5EBG8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q5EBG8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q5EBG8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q5EBG8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q5EBG8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q5EBG8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q5EBG8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q5EBG8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q5EBG8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q5EBG8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q5EBG8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q5EBG8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q5EBG8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q5EBG8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q5EBG8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q5EBG8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q5EBG8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q5EBG8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms