Protein–RNA interactions for Protein: Q571F5

Spsb3, SPRY domain-containing SOCS box protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spsb3Q571F5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spsb3Q571F5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spsb3Q571F5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spsb3Q571F5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spsb3Q571F5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spsb3Q571F5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spsb3Q571F5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Spsb3Q571F5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spsb3Q571F5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spsb3Q571F5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spsb3Q571F5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spsb3Q571F5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spsb3Q571F5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spsb3Q571F5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spsb3Q571F5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spsb3Q571F5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spsb3Q571F5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spsb3Q571F5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spsb3Q571F5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Spsb3Q571F5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spsb3Q571F5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spsb3Q571F5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spsb3Q571F5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spsb3Q571F5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spsb3Q571F5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spsb3Q571F5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spsb3Q571F5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spsb3Q571F5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spsb3Q571F5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spsb3Q571F5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spsb3Q571F5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spsb3Q571F5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spsb3Q571F5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spsb3Q571F5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spsb3Q571F5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spsb3Q571F5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Spsb3Q571F5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spsb3Q571F5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spsb3Q571F5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spsb3Q571F5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spsb3Q571F5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spsb3Q571F5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spsb3Q571F5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spsb3Q571F5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spsb3Q571F5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spsb3Q571F5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Spsb3Q571F5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spsb3Q571F5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spsb3Q571F5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spsb3Q571F5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spsb3Q571F5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spsb3Q571F5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spsb3Q571F5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spsb3Q571F5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spsb3Q571F5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spsb3Q571F5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spsb3Q571F5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spsb3Q571F5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spsb3Q571F5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spsb3Q571F5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spsb3Q571F5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spsb3Q571F5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spsb3Q571F5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spsb3Q571F5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spsb3Q571F5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spsb3Q571F5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spsb3Q571F5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spsb3Q571F5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spsb3Q571F5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spsb3Q571F5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spsb3Q571F5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Spsb3Q571F5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Spsb3Q571F5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spsb3Q571F5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spsb3Q571F5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms