Protein–RNA interactions for Protein: Q4QRL3

Ccdc88b, Coiled-coil domain-containing protein 88B, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88bQ4QRL3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Ccdc88bQ4QRL3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Ccdc88bQ4QRL3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Ccdc88bQ4QRL3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Ccdc88bQ4QRL3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Ccdc88bQ4QRL3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Ccdc88bQ4QRL3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Ccdc88bQ4QRL3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Ccdc88bQ4QRL3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Ccdc88bQ4QRL3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Ccdc88bQ4QRL3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Ccdc88bQ4QRL3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Ccdc88bQ4QRL3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Ccdc88bQ4QRL3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Ccdc88bQ4QRL3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Ccdc88bQ4QRL3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Ccdc88bQ4QRL3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ccdc88bQ4QRL3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ccdc88bQ4QRL3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ccdc88bQ4QRL3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ccdc88bQ4QRL3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ccdc88bQ4QRL3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ccdc88bQ4QRL3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ccdc88bQ4QRL3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ccdc88bQ4QRL3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ccdc88bQ4QRL3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ccdc88bQ4QRL3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ccdc88bQ4QRL3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Ccdc88bQ4QRL3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Ccdc88bQ4QRL3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Ccdc88bQ4QRL3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Ccdc88bQ4QRL3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Ccdc88bQ4QRL3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Ccdc88bQ4QRL3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Ccdc88bQ4QRL3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Ccdc88bQ4QRL3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
Ccdc88bQ4QRL3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Ccdc88bQ4QRL3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Ccdc88bQ4QRL3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Ccdc88bQ4QRL3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Ccdc88bQ4QRL3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
Ccdc88bQ4QRL3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Ccdc88bQ4QRL3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
Ccdc88bQ4QRL3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Ccdc88bQ4QRL3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Ccdc88bQ4QRL3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Ccdc88bQ4QRL3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Ccdc88bQ4QRL3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Ccdc88bQ4QRL3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Ccdc88bQ4QRL3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Ccdc88bQ4QRL3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Ccdc88bQ4QRL3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Ccdc88bQ4QRL3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Ccdc88bQ4QRL3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Ccdc88bQ4QRL3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Ccdc88bQ4QRL3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Ccdc88bQ4QRL3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
Ccdc88bQ4QRL3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
Ccdc88bQ4QRL3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Ccdc88bQ4QRL3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Ccdc88bQ4QRL3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Ccdc88bQ4QRL3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Ccdc88bQ4QRL3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Ccdc88bQ4QRL3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Ccdc88bQ4QRL3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Ccdc88bQ4QRL3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Ccdc88bQ4QRL3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Ccdc88bQ4QRL3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Ccdc88bQ4QRL3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Ccdc88bQ4QRL3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ccdc88bQ4QRL3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
Ccdc88bQ4QRL3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ccdc88bQ4QRL3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
Ccdc88bQ4QRL3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Ccdc88bQ4QRL3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Ccdc88bQ4QRL3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Ccdc88bQ4QRL3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Ccdc88bQ4QRL3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Ccdc88bQ4QRL3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Ccdc88bQ4QRL3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Ccdc88bQ4QRL3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Ccdc88bQ4QRL3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Ccdc88bQ4QRL3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
Ccdc88bQ4QRL3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Ccdc88bQ4QRL3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Ccdc88bQ4QRL3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Ccdc88bQ4QRL3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Ccdc88bQ4QRL3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Ccdc88bQ4QRL3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Ccdc88bQ4QRL3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Ccdc88bQ4QRL3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Ccdc88bQ4QRL3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Ccdc88bQ4QRL3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Ccdc88bQ4QRL3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Ccdc88bQ4QRL3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Ccdc88bQ4QRL3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Ccdc88bQ4QRL3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Ccdc88bQ4QRL3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ccdc88bQ4QRL3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ccdc88bQ4QRL3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms