Protein–RNA interactions for Protein: Q499E0

Brinp3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brinp3Q499E0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Brinp3Q499E0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Brinp3Q499E0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Brinp3Q499E0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Brinp3Q499E0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Brinp3Q499E0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Brinp3Q499E0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Brinp3Q499E0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Brinp3Q499E0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Brinp3Q499E0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Brinp3Q499E0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Brinp3Q499E0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Brinp3Q499E0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Brinp3Q499E0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Brinp3Q499E0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Brinp3Q499E0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Brinp3Q499E0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Brinp3Q499E0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Brinp3Q499E0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Brinp3Q499E0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Brinp3Q499E0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Brinp3Q499E0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Brinp3Q499E0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Brinp3Q499E0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Brinp3Q499E0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Brinp3Q499E0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Brinp3Q499E0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Brinp3Q499E0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Brinp3Q499E0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Brinp3Q499E0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Brinp3Q499E0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Brinp3Q499E0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Brinp3Q499E0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Brinp3Q499E0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Brinp3Q499E0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Brinp3Q499E0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Brinp3Q499E0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Brinp3Q499E0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Brinp3Q499E0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Brinp3Q499E0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Brinp3Q499E0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Brinp3Q499E0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Brinp3Q499E0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Brinp3Q499E0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Brinp3Q499E0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Brinp3Q499E0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Brinp3Q499E0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Brinp3Q499E0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Brinp3Q499E0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Brinp3Q499E0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Brinp3Q499E0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Brinp3Q499E0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Brinp3Q499E0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Brinp3Q499E0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Brinp3Q499E0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Brinp3Q499E0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Brinp3Q499E0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Brinp3Q499E0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Brinp3Q499E0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Brinp3Q499E0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Brinp3Q499E0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Brinp3Q499E0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Brinp3Q499E0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Brinp3Q499E0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Brinp3Q499E0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Brinp3Q499E0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Brinp3Q499E0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Brinp3Q499E0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Brinp3Q499E0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Brinp3Q499E0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Brinp3Q499E0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Brinp3Q499E0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Brinp3Q499E0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Brinp3Q499E0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Brinp3Q499E0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Brinp3Q499E0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Brinp3Q499E0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Brinp3Q499E0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Brinp3Q499E0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Brinp3Q499E0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Brinp3Q499E0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Brinp3Q499E0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Brinp3Q499E0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Brinp3Q499E0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Brinp3Q499E0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Brinp3Q499E0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Brinp3Q499E0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Brinp3Q499E0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Brinp3Q499E0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Brinp3Q499E0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Brinp3Q499E0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Brinp3Q499E0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Brinp3Q499E0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Brinp3Q499E0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Brinp3Q499E0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Brinp3Q499E0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Brinp3Q499E0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Brinp3Q499E0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Brinp3Q499E0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Brinp3Q499E0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms