Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc110Q3V125 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc110Q3V125 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc110Q3V125 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc110Q3V125 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc110Q3V125 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc110Q3V125 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc110Q3V125 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc110Q3V125 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc110Q3V125 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc110Q3V125 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc110Q3V125 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc110Q3V125 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc110Q3V125 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc110Q3V125 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc110Q3V125 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc110Q3V125 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc110Q3V125 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc110Q3V125 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc110Q3V125 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc110Q3V125 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc110Q3V125 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc110Q3V125 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc110Q3V125 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc110Q3V125 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc110Q3V125 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc110Q3V125 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc110Q3V125 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc110Q3V125 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc110Q3V125 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc110Q3V125 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc110Q3V125 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc110Q3V125 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc110Q3V125 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc110Q3V125 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc110Q3V125 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc110Q3V125 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc110Q3V125 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc110Q3V125 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc110Q3V125 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc110Q3V125 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc110Q3V125 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc110Q3V125 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc110Q3V125 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc110Q3V125 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc110Q3V125 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc110Q3V125 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc110Q3V125 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc110Q3V125 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc110Q3V125 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc110Q3V125 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc110Q3V125 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc110Q3V125 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc110Q3V125 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc110Q3V125 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc110Q3V125 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc110Q3V125 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc110Q3V125 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc110Q3V125 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc110Q3V125 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc110Q3V125 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc110Q3V125 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc110Q3V125 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc110Q3V125 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc110Q3V125 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc110Q3V125 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc110Q3V125 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc110Q3V125 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc110Q3V125 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc110Q3V125 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc110Q3V125 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc110Q3V125 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc110Q3V125 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc110Q3V125 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc110Q3V125 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc110Q3V125 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc110Q3V125 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc110Q3V125 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc110Q3V125 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc110Q3V125 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc110Q3V125 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc110Q3V125 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc110Q3V125 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc110Q3V125 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc110Q3V125 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc110Q3V125 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc110Q3V125 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc110Q3V125 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc110Q3V125 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc110Q3V125 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc110Q3V125 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc110Q3V125 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc110Q3V125 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc110Q3V125 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc110Q3V125 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc110Q3V125 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc110Q3V125 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc110Q3V125 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc110Q3V125 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc110Q3V125 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms