Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q1

Dnah12, Dynein heavy chain 12, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 3,086 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah12Q3V0Q1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnah12Q3V0Q1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnah12Q3V0Q1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnah12Q3V0Q1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnah12Q3V0Q1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dnah12Q3V0Q1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dnah12Q3V0Q1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dnah12Q3V0Q1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dnah12Q3V0Q1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Dnah12Q3V0Q1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Dnah12Q3V0Q1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Dnah12Q3V0Q1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
Dnah12Q3V0Q1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Dnah12Q3V0Q1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Dnah12Q3V0Q1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Dnah12Q3V0Q1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Dnah12Q3V0Q1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Dnah12Q3V0Q1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Dnah12Q3V0Q1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dnah12Q3V0Q1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dnah12Q3V0Q1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dnah12Q3V0Q1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Dnah12Q3V0Q1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dnah12Q3V0Q1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dnah12Q3V0Q1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dnah12Q3V0Q1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dnah12Q3V0Q1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnah12Q3V0Q1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnah12Q3V0Q1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnah12Q3V0Q1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Dnah12Q3V0Q1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnah12Q3V0Q1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Dnah12Q3V0Q1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnah12Q3V0Q1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnah12Q3V0Q1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dnah12Q3V0Q1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dnah12Q3V0Q1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dnah12Q3V0Q1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Dnah12Q3V0Q1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dnah12Q3V0Q1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dnah12Q3V0Q1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dnah12Q3V0Q1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dnah12Q3V0Q1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dnah12Q3V0Q1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Dnah12Q3V0Q1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dnah12Q3V0Q1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dnah12Q3V0Q1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dnah12Q3V0Q1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnah12Q3V0Q1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnah12Q3V0Q1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnah12Q3V0Q1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnah12Q3V0Q1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Dnah12Q3V0Q1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnah12Q3V0Q1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnah12Q3V0Q1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Dnah12Q3V0Q1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnah12Q3V0Q1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnah12Q3V0Q1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Dnah12Q3V0Q1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Dnah12Q3V0Q1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnah12Q3V0Q1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnah12Q3V0Q1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Dnah12Q3V0Q1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnah12Q3V0Q1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnah12Q3V0Q1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnah12Q3V0Q1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnah12Q3V0Q1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnah12Q3V0Q1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Dnah12Q3V0Q1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnah12Q3V0Q1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dnah12Q3V0Q1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dnah12Q3V0Q1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dnah12Q3V0Q1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dnah12Q3V0Q1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Dnah12Q3V0Q1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dnah12Q3V0Q1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dnah12Q3V0Q1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dnah12Q3V0Q1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Dnah12Q3V0Q1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Dnah12Q3V0Q1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Dnah12Q3V0Q1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Dnah12Q3V0Q1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Dnah12Q3V0Q1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnah12Q3V0Q1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnah12Q3V0Q1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnah12Q3V0Q1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnah12Q3V0Q1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnah12Q3V0Q1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnah12Q3V0Q1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnah12Q3V0Q1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnah12Q3V0Q1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnah12Q3V0Q1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnah12Q3V0Q1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnah12Q3V0Q1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnah12Q3V0Q1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnah12Q3V0Q1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnah12Q3V0Q1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnah12Q3V0Q1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnah12Q3V0Q1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnah12Q3V0Q1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 223 ms