Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTQ8

Cdkl5, Cyclin-dependent kinase-like 5, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl5Q3UTQ8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdkl5Q3UTQ8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdkl5Q3UTQ8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdkl5Q3UTQ8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdkl5Q3UTQ8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdkl5Q3UTQ8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdkl5Q3UTQ8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdkl5Q3UTQ8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdkl5Q3UTQ8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdkl5Q3UTQ8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdkl5Q3UTQ8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdkl5Q3UTQ8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdkl5Q3UTQ8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdkl5Q3UTQ8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdkl5Q3UTQ8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cdkl5Q3UTQ8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdkl5Q3UTQ8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdkl5Q3UTQ8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdkl5Q3UTQ8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdkl5Q3UTQ8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdkl5Q3UTQ8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdkl5Q3UTQ8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdkl5Q3UTQ8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdkl5Q3UTQ8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdkl5Q3UTQ8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdkl5Q3UTQ8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdkl5Q3UTQ8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdkl5Q3UTQ8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdkl5Q3UTQ8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdkl5Q3UTQ8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdkl5Q3UTQ8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdkl5Q3UTQ8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdkl5Q3UTQ8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdkl5Q3UTQ8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdkl5Q3UTQ8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdkl5Q3UTQ8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdkl5Q3UTQ8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdkl5Q3UTQ8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdkl5Q3UTQ8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdkl5Q3UTQ8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdkl5Q3UTQ8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdkl5Q3UTQ8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdkl5Q3UTQ8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdkl5Q3UTQ8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdkl5Q3UTQ8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdkl5Q3UTQ8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdkl5Q3UTQ8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdkl5Q3UTQ8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdkl5Q3UTQ8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdkl5Q3UTQ8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdkl5Q3UTQ8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdkl5Q3UTQ8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdkl5Q3UTQ8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdkl5Q3UTQ8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdkl5Q3UTQ8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdkl5Q3UTQ8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdkl5Q3UTQ8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdkl5Q3UTQ8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdkl5Q3UTQ8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdkl5Q3UTQ8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdkl5Q3UTQ8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdkl5Q3UTQ8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cdkl5Q3UTQ8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cdkl5Q3UTQ8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdkl5Q3UTQ8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdkl5Q3UTQ8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdkl5Q3UTQ8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdkl5Q3UTQ8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdkl5Q3UTQ8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdkl5Q3UTQ8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdkl5Q3UTQ8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdkl5Q3UTQ8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdkl5Q3UTQ8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdkl5Q3UTQ8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdkl5Q3UTQ8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdkl5Q3UTQ8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdkl5Q3UTQ8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdkl5Q3UTQ8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdkl5Q3UTQ8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdkl5Q3UTQ8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdkl5Q3UTQ8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdkl5Q3UTQ8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdkl5Q3UTQ8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdkl5Q3UTQ8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdkl5Q3UTQ8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdkl5Q3UTQ8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdkl5Q3UTQ8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdkl5Q3UTQ8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdkl5Q3UTQ8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdkl5Q3UTQ8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdkl5Q3UTQ8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdkl5Q3UTQ8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdkl5Q3UTQ8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdkl5Q3UTQ8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdkl5Q3UTQ8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdkl5Q3UTQ8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdkl5Q3UTQ8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdkl5Q3UTQ8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdkl5Q3UTQ8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdkl5Q3UTQ8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms