Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQS8

Rbm20, RNA-binding protein 20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm20Q3UQS8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rbm20Q3UQS8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rbm20Q3UQS8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Rbm20Q3UQS8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Rbm20Q3UQS8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Rbm20Q3UQS8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rbm20Q3UQS8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rbm20Q3UQS8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Rbm20Q3UQS8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rbm20Q3UQS8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rbm20Q3UQS8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rbm20Q3UQS8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rbm20Q3UQS8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rbm20Q3UQS8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rbm20Q3UQS8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rbm20Q3UQS8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rbm20Q3UQS8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rbm20Q3UQS8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rbm20Q3UQS8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rbm20Q3UQS8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rbm20Q3UQS8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rbm20Q3UQS8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rbm20Q3UQS8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rbm20Q3UQS8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rbm20Q3UQS8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rbm20Q3UQS8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rbm20Q3UQS8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rbm20Q3UQS8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rbm20Q3UQS8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rbm20Q3UQS8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rbm20Q3UQS8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rbm20Q3UQS8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rbm20Q3UQS8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rbm20Q3UQS8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rbm20Q3UQS8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rbm20Q3UQS8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rbm20Q3UQS8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rbm20Q3UQS8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rbm20Q3UQS8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rbm20Q3UQS8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rbm20Q3UQS8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rbm20Q3UQS8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rbm20Q3UQS8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rbm20Q3UQS8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rbm20Q3UQS8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rbm20Q3UQS8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rbm20Q3UQS8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Rbm20Q3UQS8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rbm20Q3UQS8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rbm20Q3UQS8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rbm20Q3UQS8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rbm20Q3UQS8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rbm20Q3UQS8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rbm20Q3UQS8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Rbm20Q3UQS8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rbm20Q3UQS8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rbm20Q3UQS8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rbm20Q3UQS8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rbm20Q3UQS8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rbm20Q3UQS8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rbm20Q3UQS8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rbm20Q3UQS8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rbm20Q3UQS8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rbm20Q3UQS8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rbm20Q3UQS8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rbm20Q3UQS8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rbm20Q3UQS8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rbm20Q3UQS8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rbm20Q3UQS8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rbm20Q3UQS8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rbm20Q3UQS8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rbm20Q3UQS8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rbm20Q3UQS8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rbm20Q3UQS8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rbm20Q3UQS8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbm20Q3UQS8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbm20Q3UQS8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbm20Q3UQS8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbm20Q3UQS8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbm20Q3UQS8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbm20Q3UQS8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rbm20Q3UQS8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rbm20Q3UQS8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rbm20Q3UQS8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rbm20Q3UQS8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rbm20Q3UQS8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rbm20Q3UQS8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rbm20Q3UQS8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbm20Q3UQS8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbm20Q3UQS8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbm20Q3UQS8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbm20Q3UQS8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbm20Q3UQS8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbm20Q3UQS8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbm20Q3UQS8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbm20Q3UQS8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbm20Q3UQS8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbm20Q3UQS8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbm20Q3UQS8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbm20Q3UQS8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms