Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJP5

Protein C8orf37 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UJP5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q3UJP5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q3UJP5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q3UJP5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q3UJP5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q3UJP5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q3UJP5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q3UJP5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q3UJP5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q3UJP5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q3UJP5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q3UJP5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q3UJP5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q3UJP5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q3UJP5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q3UJP5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q3UJP5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q3UJP5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Q3UJP5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q3UJP5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q3UJP5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q3UJP5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q3UJP5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q3UJP5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q3UJP5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q3UJP5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q3UJP5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q3UJP5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q3UJP5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q3UJP5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Q3UJP5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q3UJP5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Q3UJP5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Q3UJP5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q3UJP5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q3UJP5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q3UJP5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q3UJP5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q3UJP5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q3UJP5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q3UJP5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q3UJP5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q3UJP5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q3UJP5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q3UJP5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q3UJP5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q3UJP5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q3UJP5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q3UJP5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q3UJP5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q3UJP5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q3UJP5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q3UJP5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q3UJP5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q3UJP5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q3UJP5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q3UJP5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q3UJP5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q3UJP5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q3UJP5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q3UJP5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q3UJP5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q3UJP5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q3UJP5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q3UJP5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q3UJP5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q3UJP5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q3UJP5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q3UJP5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q3UJP5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q3UJP5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q3UJP5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q3UJP5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q3UJP5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q3UJP5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q3UJP5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Q3UJP5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Q3UJP5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Q3UJP5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q3UJP5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q3UJP5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q3UJP5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q3UJP5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q3UJP5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q3UJP5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q3UJP5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q3UJP5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q3UJP5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q3UJP5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q3UJP5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q3UJP5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Q3UJP5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Q3UJP5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Q3UJP5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q3UJP5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q3UJP5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q3UJP5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q3UJP5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Q3UJP5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Q3UJP5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.3 ms