Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHH1

Zswim8, Zinc finger SWIM domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zswim8Q3UHH1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zswim8Q3UHH1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zswim8Q3UHH1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zswim8Q3UHH1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zswim8Q3UHH1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zswim8Q3UHH1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zswim8Q3UHH1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zswim8Q3UHH1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zswim8Q3UHH1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zswim8Q3UHH1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zswim8Q3UHH1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zswim8Q3UHH1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zswim8Q3UHH1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Zswim8Q3UHH1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Zswim8Q3UHH1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Zswim8Q3UHH1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Zswim8Q3UHH1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Zswim8Q3UHH1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Zswim8Q3UHH1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Zswim8Q3UHH1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Zswim8Q3UHH1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Zswim8Q3UHH1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Zswim8Q3UHH1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zswim8Q3UHH1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zswim8Q3UHH1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zswim8Q3UHH1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zswim8Q3UHH1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zswim8Q3UHH1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zswim8Q3UHH1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zswim8Q3UHH1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zswim8Q3UHH1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zswim8Q3UHH1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zswim8Q3UHH1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zswim8Q3UHH1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zswim8Q3UHH1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zswim8Q3UHH1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zswim8Q3UHH1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zswim8Q3UHH1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zswim8Q3UHH1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zswim8Q3UHH1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zswim8Q3UHH1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zswim8Q3UHH1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zswim8Q3UHH1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zswim8Q3UHH1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zswim8Q3UHH1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zswim8Q3UHH1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zswim8Q3UHH1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zswim8Q3UHH1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zswim8Q3UHH1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Zswim8Q3UHH1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Zswim8Q3UHH1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Zswim8Q3UHH1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zswim8Q3UHH1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Zswim8Q3UHH1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zswim8Q3UHH1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zswim8Q3UHH1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zswim8Q3UHH1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zswim8Q3UHH1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zswim8Q3UHH1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zswim8Q3UHH1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zswim8Q3UHH1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zswim8Q3UHH1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zswim8Q3UHH1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zswim8Q3UHH1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Zswim8Q3UHH1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zswim8Q3UHH1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zswim8Q3UHH1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zswim8Q3UHH1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zswim8Q3UHH1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zswim8Q3UHH1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zswim8Q3UHH1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zswim8Q3UHH1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Zswim8Q3UHH1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zswim8Q3UHH1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zswim8Q3UHH1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zswim8Q3UHH1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zswim8Q3UHH1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zswim8Q3UHH1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zswim8Q3UHH1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zswim8Q3UHH1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zswim8Q3UHH1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Zswim8Q3UHH1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Zswim8Q3UHH1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Zswim8Q3UHH1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Zswim8Q3UHH1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Zswim8Q3UHH1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Zswim8Q3UHH1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Zswim8Q3UHH1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Zswim8Q3UHH1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Zswim8Q3UHH1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Zswim8Q3UHH1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zswim8Q3UHH1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zswim8Q3UHH1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zswim8Q3UHH1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zswim8Q3UHH1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zswim8Q3UHH1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zswim8Q3UHH1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zswim8Q3UHH1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zswim8Q3UHH1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zswim8Q3UHH1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms