Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHC1

Rapgef1, Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef1Q3UHC1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rapgef1Q3UHC1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rapgef1Q3UHC1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rapgef1Q3UHC1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rapgef1Q3UHC1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rapgef1Q3UHC1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rapgef1Q3UHC1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rapgef1Q3UHC1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rapgef1Q3UHC1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rapgef1Q3UHC1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rapgef1Q3UHC1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rapgef1Q3UHC1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rapgef1Q3UHC1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rapgef1Q3UHC1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rapgef1Q3UHC1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rapgef1Q3UHC1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rapgef1Q3UHC1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rapgef1Q3UHC1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rapgef1Q3UHC1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rapgef1Q3UHC1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rapgef1Q3UHC1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rapgef1Q3UHC1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rapgef1Q3UHC1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rapgef1Q3UHC1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rapgef1Q3UHC1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rapgef1Q3UHC1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rapgef1Q3UHC1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rapgef1Q3UHC1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rapgef1Q3UHC1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rapgef1Q3UHC1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rapgef1Q3UHC1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rapgef1Q3UHC1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rapgef1Q3UHC1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rapgef1Q3UHC1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rapgef1Q3UHC1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rapgef1Q3UHC1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rapgef1Q3UHC1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rapgef1Q3UHC1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rapgef1Q3UHC1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rapgef1Q3UHC1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rapgef1Q3UHC1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rapgef1Q3UHC1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rapgef1Q3UHC1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rapgef1Q3UHC1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rapgef1Q3UHC1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rapgef1Q3UHC1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rapgef1Q3UHC1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rapgef1Q3UHC1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rapgef1Q3UHC1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rapgef1Q3UHC1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rapgef1Q3UHC1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rapgef1Q3UHC1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rapgef1Q3UHC1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rapgef1Q3UHC1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rapgef1Q3UHC1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rapgef1Q3UHC1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rapgef1Q3UHC1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rapgef1Q3UHC1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rapgef1Q3UHC1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rapgef1Q3UHC1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rapgef1Q3UHC1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rapgef1Q3UHC1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rapgef1Q3UHC1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rapgef1Q3UHC1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rapgef1Q3UHC1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rapgef1Q3UHC1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rapgef1Q3UHC1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rapgef1Q3UHC1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rapgef1Q3UHC1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rapgef1Q3UHC1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rapgef1Q3UHC1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rapgef1Q3UHC1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rapgef1Q3UHC1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rapgef1Q3UHC1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rapgef1Q3UHC1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rapgef1Q3UHC1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rapgef1Q3UHC1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rapgef1Q3UHC1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rapgef1Q3UHC1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rapgef1Q3UHC1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rapgef1Q3UHC1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rapgef1Q3UHC1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rapgef1Q3UHC1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rapgef1Q3UHC1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rapgef1Q3UHC1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rapgef1Q3UHC1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rapgef1Q3UHC1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rapgef1Q3UHC1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rapgef1Q3UHC1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rapgef1Q3UHC1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rapgef1Q3UHC1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rapgef1Q3UHC1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rapgef1Q3UHC1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rapgef1Q3UHC1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rapgef1Q3UHC1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rapgef1Q3UHC1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rapgef1Q3UHC1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rapgef1Q3UHC1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rapgef1Q3UHC1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rapgef1Q3UHC1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms