Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY0

Rrp36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp36Q3UFY0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rrp36Q3UFY0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rrp36Q3UFY0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rrp36Q3UFY0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rrp36Q3UFY0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rrp36Q3UFY0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rrp36Q3UFY0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rrp36Q3UFY0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rrp36Q3UFY0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rrp36Q3UFY0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rrp36Q3UFY0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rrp36Q3UFY0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rrp36Q3UFY0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rrp36Q3UFY0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rrp36Q3UFY0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rrp36Q3UFY0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rrp36Q3UFY0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Rrp36Q3UFY0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rrp36Q3UFY0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rrp36Q3UFY0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rrp36Q3UFY0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rrp36Q3UFY0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rrp36Q3UFY0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rrp36Q3UFY0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rrp36Q3UFY0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rrp36Q3UFY0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rrp36Q3UFY0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rrp36Q3UFY0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rrp36Q3UFY0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rrp36Q3UFY0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rrp36Q3UFY0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rrp36Q3UFY0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rrp36Q3UFY0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rrp36Q3UFY0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rrp36Q3UFY0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rrp36Q3UFY0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rrp36Q3UFY0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rrp36Q3UFY0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rrp36Q3UFY0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rrp36Q3UFY0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rrp36Q3UFY0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rrp36Q3UFY0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rrp36Q3UFY0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Rrp36Q3UFY0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rrp36Q3UFY0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rrp36Q3UFY0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rrp36Q3UFY0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rrp36Q3UFY0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rrp36Q3UFY0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rrp36Q3UFY0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rrp36Q3UFY0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rrp36Q3UFY0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rrp36Q3UFY0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rrp36Q3UFY0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Rrp36Q3UFY0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rrp36Q3UFY0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rrp36Q3UFY0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rrp36Q3UFY0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rrp36Q3UFY0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rrp36Q3UFY0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rrp36Q3UFY0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rrp36Q3UFY0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rrp36Q3UFY0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rrp36Q3UFY0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rrp36Q3UFY0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rrp36Q3UFY0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rrp36Q3UFY0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rrp36Q3UFY0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rrp36Q3UFY0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rrp36Q3UFY0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rrp36Q3UFY0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rrp36Q3UFY0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rrp36Q3UFY0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rrp36Q3UFY0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rrp36Q3UFY0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rrp36Q3UFY0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rrp36Q3UFY0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rrp36Q3UFY0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rrp36Q3UFY0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rrp36Q3UFY0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rrp36Q3UFY0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rrp36Q3UFY0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rrp36Q3UFY0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rrp36Q3UFY0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rrp36Q3UFY0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rrp36Q3UFY0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rrp36Q3UFY0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rrp36Q3UFY0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rrp36Q3UFY0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rrp36Q3UFY0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rrp36Q3UFY0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rrp36Q3UFY0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rrp36Q3UFY0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rrp36Q3UFY0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rrp36Q3UFY0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rrp36Q3UFY0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rrp36Q3UFY0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rrp36Q3UFY0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rrp36Q3UFY0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rrp36Q3UFY0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms