Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFS0

Zyg11b, Protein zyg-11 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zyg11bQ3UFS0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Zyg11bQ3UFS0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Zyg11bQ3UFS0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Zyg11bQ3UFS0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Zyg11bQ3UFS0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Zyg11bQ3UFS0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Zyg11bQ3UFS0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Zyg11bQ3UFS0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Zyg11bQ3UFS0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Zyg11bQ3UFS0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Zyg11bQ3UFS0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Zyg11bQ3UFS0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Zyg11bQ3UFS0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Zyg11bQ3UFS0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Zyg11bQ3UFS0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Zyg11bQ3UFS0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Zyg11bQ3UFS0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Zyg11bQ3UFS0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Zyg11bQ3UFS0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Zyg11bQ3UFS0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Zyg11bQ3UFS0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Zyg11bQ3UFS0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Zyg11bQ3UFS0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zyg11bQ3UFS0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zyg11bQ3UFS0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zyg11bQ3UFS0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zyg11bQ3UFS0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zyg11bQ3UFS0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zyg11bQ3UFS0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zyg11bQ3UFS0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zyg11bQ3UFS0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zyg11bQ3UFS0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zyg11bQ3UFS0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zyg11bQ3UFS0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zyg11bQ3UFS0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zyg11bQ3UFS0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zyg11bQ3UFS0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zyg11bQ3UFS0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zyg11bQ3UFS0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zyg11bQ3UFS0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zyg11bQ3UFS0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zyg11bQ3UFS0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zyg11bQ3UFS0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zyg11bQ3UFS0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zyg11bQ3UFS0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zyg11bQ3UFS0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zyg11bQ3UFS0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zyg11bQ3UFS0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zyg11bQ3UFS0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zyg11bQ3UFS0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zyg11bQ3UFS0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zyg11bQ3UFS0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zyg11bQ3UFS0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zyg11bQ3UFS0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zyg11bQ3UFS0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zyg11bQ3UFS0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zyg11bQ3UFS0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zyg11bQ3UFS0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zyg11bQ3UFS0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zyg11bQ3UFS0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Zyg11bQ3UFS0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zyg11bQ3UFS0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zyg11bQ3UFS0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zyg11bQ3UFS0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zyg11bQ3UFS0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zyg11bQ3UFS0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Zyg11bQ3UFS0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zyg11bQ3UFS0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zyg11bQ3UFS0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zyg11bQ3UFS0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zyg11bQ3UFS0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zyg11bQ3UFS0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zyg11bQ3UFS0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zyg11bQ3UFS0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zyg11bQ3UFS0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zyg11bQ3UFS0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zyg11bQ3UFS0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zyg11bQ3UFS0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Zyg11bQ3UFS0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zyg11bQ3UFS0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Zyg11bQ3UFS0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Zyg11bQ3UFS0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zyg11bQ3UFS0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zyg11bQ3UFS0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zyg11bQ3UFS0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zyg11bQ3UFS0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zyg11bQ3UFS0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zyg11bQ3UFS0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zyg11bQ3UFS0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zyg11bQ3UFS0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zyg11bQ3UFS0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zyg11bQ3UFS0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zyg11bQ3UFS0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zyg11bQ3UFS0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zyg11bQ3UFS0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zyg11bQ3UFS0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zyg11bQ3UFS0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zyg11bQ3UFS0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zyg11bQ3UFS0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zyg11bQ3UFS0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms