Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3R4

Lmf1, Lipase maturation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmf1Q3U3R4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmf1Q3U3R4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmf1Q3U3R4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmf1Q3U3R4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmf1Q3U3R4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmf1Q3U3R4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmf1Q3U3R4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmf1Q3U3R4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmf1Q3U3R4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmf1Q3U3R4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmf1Q3U3R4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmf1Q3U3R4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmf1Q3U3R4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmf1Q3U3R4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmf1Q3U3R4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmf1Q3U3R4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmf1Q3U3R4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmf1Q3U3R4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmf1Q3U3R4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmf1Q3U3R4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lmf1Q3U3R4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lmf1Q3U3R4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmf1Q3U3R4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmf1Q3U3R4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmf1Q3U3R4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmf1Q3U3R4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmf1Q3U3R4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmf1Q3U3R4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmf1Q3U3R4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmf1Q3U3R4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmf1Q3U3R4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmf1Q3U3R4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmf1Q3U3R4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmf1Q3U3R4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmf1Q3U3R4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmf1Q3U3R4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmf1Q3U3R4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmf1Q3U3R4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmf1Q3U3R4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmf1Q3U3R4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmf1Q3U3R4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmf1Q3U3R4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmf1Q3U3R4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmf1Q3U3R4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmf1Q3U3R4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmf1Q3U3R4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmf1Q3U3R4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmf1Q3U3R4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmf1Q3U3R4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmf1Q3U3R4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmf1Q3U3R4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmf1Q3U3R4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmf1Q3U3R4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmf1Q3U3R4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmf1Q3U3R4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmf1Q3U3R4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmf1Q3U3R4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmf1Q3U3R4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmf1Q3U3R4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmf1Q3U3R4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmf1Q3U3R4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmf1Q3U3R4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmf1Q3U3R4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmf1Q3U3R4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmf1Q3U3R4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmf1Q3U3R4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmf1Q3U3R4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmf1Q3U3R4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmf1Q3U3R4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmf1Q3U3R4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmf1Q3U3R4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmf1Q3U3R4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmf1Q3U3R4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmf1Q3U3R4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmf1Q3U3R4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmf1Q3U3R4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmf1Q3U3R4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lmf1Q3U3R4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Lmf1Q3U3R4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lmf1Q3U3R4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lmf1Q3U3R4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmf1Q3U3R4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmf1Q3U3R4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmf1Q3U3R4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmf1Q3U3R4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmf1Q3U3R4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmf1Q3U3R4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmf1Q3U3R4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmf1Q3U3R4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmf1Q3U3R4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmf1Q3U3R4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmf1Q3U3R4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmf1Q3U3R4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmf1Q3U3R4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmf1Q3U3R4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmf1Q3U3R4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmf1Q3U3R4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmf1Q3U3R4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmf1Q3U3R4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmf1Q3U3R4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms