Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCH7

Cul4a, Cullin-4A, mousemouse

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4aQ3TCH7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cul4aQ3TCH7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cul4aQ3TCH7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Cul4aQ3TCH7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cul4aQ3TCH7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cul4aQ3TCH7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cul4aQ3TCH7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cul4aQ3TCH7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cul4aQ3TCH7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cul4aQ3TCH7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cul4aQ3TCH7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cul4aQ3TCH7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cul4aQ3TCH7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cul4aQ3TCH7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cul4aQ3TCH7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Cul4aQ3TCH7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cul4aQ3TCH7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cul4aQ3TCH7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cul4aQ3TCH7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cul4aQ3TCH7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cul4aQ3TCH7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cul4aQ3TCH7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Cul4aQ3TCH7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cul4aQ3TCH7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cul4aQ3TCH7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Cul4aQ3TCH7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cul4aQ3TCH7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cul4aQ3TCH7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
Cul4aQ3TCH7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cul4aQ3TCH7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cul4aQ3TCH7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cul4aQ3TCH7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cul4aQ3TCH7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cul4aQ3TCH7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cul4aQ3TCH7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cul4aQ3TCH7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cul4aQ3TCH7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cul4aQ3TCH7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cul4aQ3TCH7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cul4aQ3TCH7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cul4aQ3TCH7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cul4aQ3TCH7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cul4aQ3TCH7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cul4aQ3TCH7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cul4aQ3TCH7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cul4aQ3TCH7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cul4aQ3TCH7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cul4aQ3TCH7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cul4aQ3TCH7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cul4aQ3TCH7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cul4aQ3TCH7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cul4aQ3TCH7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cul4aQ3TCH7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cul4aQ3TCH7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cul4aQ3TCH7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cul4aQ3TCH7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cul4aQ3TCH7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cul4aQ3TCH7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cul4aQ3TCH7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cul4aQ3TCH7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cul4aQ3TCH7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cul4aQ3TCH7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cul4aQ3TCH7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cul4aQ3TCH7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cul4aQ3TCH7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cul4aQ3TCH7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cul4aQ3TCH7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cul4aQ3TCH7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cul4aQ3TCH7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cul4aQ3TCH7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cul4aQ3TCH7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cul4aQ3TCH7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cul4aQ3TCH7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cul4aQ3TCH7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cul4aQ3TCH7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cul4aQ3TCH7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cul4aQ3TCH7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cul4aQ3TCH7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cul4aQ3TCH7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cul4aQ3TCH7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cul4aQ3TCH7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cul4aQ3TCH7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cul4aQ3TCH7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cul4aQ3TCH7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cul4aQ3TCH7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cul4aQ3TCH7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cul4aQ3TCH7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cul4aQ3TCH7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cul4aQ3TCH7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cul4aQ3TCH7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cul4aQ3TCH7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cul4aQ3TCH7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cul4aQ3TCH7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cul4aQ3TCH7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cul4aQ3TCH7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cul4aQ3TCH7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cul4aQ3TCH7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cul4aQ3TCH7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cul4aQ3TCH7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cul4aQ3TCH7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms