Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
H2-M3Q31093 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
H2-M3Q31093 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
H2-M3Q31093 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
H2-M3Q31093 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
H2-M3Q31093 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
H2-M3Q31093 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
H2-M3Q31093 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
H2-M3Q31093 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
H2-M3Q31093 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
H2-M3Q31093 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
H2-M3Q31093 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
H2-M3Q31093 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
H2-M3Q31093 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
H2-M3Q31093 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
H2-M3Q31093 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
H2-M3Q31093 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
H2-M3Q31093 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
H2-M3Q31093 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
H2-M3Q31093 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
H2-M3Q31093 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
H2-M3Q31093 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
H2-M3Q31093 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
H2-M3Q31093 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
H2-M3Q31093 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
H2-M3Q31093 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
H2-M3Q31093 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
H2-M3Q31093 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
H2-M3Q31093 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
H2-M3Q31093 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
H2-M3Q31093 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
H2-M3Q31093 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
H2-M3Q31093 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
H2-M3Q31093 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
H2-M3Q31093 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
H2-M3Q31093 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
H2-M3Q31093 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
H2-M3Q31093 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
H2-M3Q31093 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
H2-M3Q31093 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
H2-M3Q31093 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
H2-M3Q31093 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
H2-M3Q31093 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
H2-M3Q31093 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
H2-M3Q31093 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
H2-M3Q31093 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
H2-M3Q31093 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
H2-M3Q31093 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
H2-M3Q31093 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
H2-M3Q31093 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
H2-M3Q31093 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
H2-M3Q31093 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
H2-M3Q31093 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
H2-M3Q31093 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
H2-M3Q31093 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
H2-M3Q31093 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
H2-M3Q31093 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
H2-M3Q31093 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
H2-M3Q31093 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
H2-M3Q31093 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
H2-M3Q31093 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
H2-M3Q31093 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
H2-M3Q31093 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
H2-M3Q31093 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
H2-M3Q31093 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
H2-M3Q31093 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
H2-M3Q31093 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
H2-M3Q31093 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
H2-M3Q31093 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
H2-M3Q31093 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-M3Q31093 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-M3Q31093 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-M3Q31093 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-M3Q31093 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-M3Q31093 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-M3Q31093 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-M3Q31093 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-M3Q31093 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-M3Q31093 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-M3Q31093 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-M3Q31093 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-M3Q31093 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-M3Q31093 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-M3Q31093 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-M3Q31093 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-M3Q31093 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-M3Q31093 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-M3Q31093 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-M3Q31093 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-M3Q31093 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-M3Q31093 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-M3Q31093 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-M3Q31093 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-M3Q31093 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-M3Q31093 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-M3Q31093 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-M3Q31093 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-M3Q31093 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-M3Q31093 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-M3Q31093 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms