Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc162pQ0VG85 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc162pQ0VG85 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc162pQ0VG85 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc162pQ0VG85 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc162pQ0VG85 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc162pQ0VG85 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc162pQ0VG85 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc162pQ0VG85 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc162pQ0VG85 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc162pQ0VG85 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc162pQ0VG85 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc162pQ0VG85 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc162pQ0VG85 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc162pQ0VG85 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc162pQ0VG85 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc162pQ0VG85 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc162pQ0VG85 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc162pQ0VG85 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc162pQ0VG85 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc162pQ0VG85 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc162pQ0VG85 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc162pQ0VG85 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc162pQ0VG85 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc162pQ0VG85 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc162pQ0VG85 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc162pQ0VG85 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc162pQ0VG85 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc162pQ0VG85 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc162pQ0VG85 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc162pQ0VG85 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc162pQ0VG85 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc162pQ0VG85 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc162pQ0VG85 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc162pQ0VG85 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc162pQ0VG85 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc162pQ0VG85 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc162pQ0VG85 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc162pQ0VG85 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc162pQ0VG85 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc162pQ0VG85 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc162pQ0VG85 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc162pQ0VG85 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc162pQ0VG85 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc162pQ0VG85 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc162pQ0VG85 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc162pQ0VG85 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc162pQ0VG85 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc162pQ0VG85 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc162pQ0VG85 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc162pQ0VG85 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc162pQ0VG85 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc162pQ0VG85 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc162pQ0VG85 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc162pQ0VG85 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc162pQ0VG85 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc162pQ0VG85 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc162pQ0VG85 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc162pQ0VG85 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc162pQ0VG85 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc162pQ0VG85 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc162pQ0VG85 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc162pQ0VG85 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc162pQ0VG85 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc162pQ0VG85 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc162pQ0VG85 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc162pQ0VG85 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc162pQ0VG85 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc162pQ0VG85 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc162pQ0VG85 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc162pQ0VG85 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc162pQ0VG85 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc162pQ0VG85 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc162pQ0VG85 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc162pQ0VG85 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc162pQ0VG85 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc162pQ0VG85 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc162pQ0VG85 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc162pQ0VG85 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc162pQ0VG85 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc162pQ0VG85 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc162pQ0VG85 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc162pQ0VG85 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc162pQ0VG85 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc162pQ0VG85 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc162pQ0VG85 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc162pQ0VG85 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc162pQ0VG85 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc162pQ0VG85 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc162pQ0VG85 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc162pQ0VG85 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc162pQ0VG85 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc162pQ0VG85 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc162pQ0VG85 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc162pQ0VG85 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc162pQ0VG85 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc162pQ0VG85 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc162pQ0VG85 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc162pQ0VG85 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc162pQ0VG85 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms