Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF2

Tmem52b, Transmembrane protein 52B, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem52bQ0VBF2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem52bQ0VBF2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem52bQ0VBF2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem52bQ0VBF2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem52bQ0VBF2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem52bQ0VBF2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem52bQ0VBF2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem52bQ0VBF2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem52bQ0VBF2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem52bQ0VBF2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem52bQ0VBF2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem52bQ0VBF2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem52bQ0VBF2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem52bQ0VBF2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem52bQ0VBF2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem52bQ0VBF2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem52bQ0VBF2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem52bQ0VBF2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem52bQ0VBF2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem52bQ0VBF2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem52bQ0VBF2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem52bQ0VBF2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem52bQ0VBF2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem52bQ0VBF2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem52bQ0VBF2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem52bQ0VBF2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem52bQ0VBF2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem52bQ0VBF2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem52bQ0VBF2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem52bQ0VBF2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem52bQ0VBF2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem52bQ0VBF2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem52bQ0VBF2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tmem52bQ0VBF2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem52bQ0VBF2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem52bQ0VBF2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem52bQ0VBF2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem52bQ0VBF2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem52bQ0VBF2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem52bQ0VBF2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem52bQ0VBF2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem52bQ0VBF2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem52bQ0VBF2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem52bQ0VBF2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem52bQ0VBF2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem52bQ0VBF2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem52bQ0VBF2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem52bQ0VBF2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem52bQ0VBF2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem52bQ0VBF2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem52bQ0VBF2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem52bQ0VBF2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem52bQ0VBF2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem52bQ0VBF2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem52bQ0VBF2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem52bQ0VBF2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem52bQ0VBF2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem52bQ0VBF2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem52bQ0VBF2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem52bQ0VBF2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem52bQ0VBF2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem52bQ0VBF2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem52bQ0VBF2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem52bQ0VBF2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem52bQ0VBF2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem52bQ0VBF2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem52bQ0VBF2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem52bQ0VBF2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem52bQ0VBF2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem52bQ0VBF2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem52bQ0VBF2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem52bQ0VBF2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem52bQ0VBF2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem52bQ0VBF2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem52bQ0VBF2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem52bQ0VBF2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem52bQ0VBF2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem52bQ0VBF2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem52bQ0VBF2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem52bQ0VBF2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem52bQ0VBF2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem52bQ0VBF2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem52bQ0VBF2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem52bQ0VBF2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem52bQ0VBF2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem52bQ0VBF2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem52bQ0VBF2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem52bQ0VBF2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem52bQ0VBF2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem52bQ0VBF2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem52bQ0VBF2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem52bQ0VBF2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem52bQ0VBF2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem52bQ0VBF2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem52bQ0VBF2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem52bQ0VBF2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem52bQ0VBF2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem52bQ0VBF2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem52bQ0VBF2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem52bQ0VBF2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms