Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tgm3Q08189 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tgm3Q08189 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tgm3Q08189 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tgm3Q08189 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tgm3Q08189 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tgm3Q08189 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tgm3Q08189 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tgm3Q08189 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tgm3Q08189 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tgm3Q08189 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tgm3Q08189 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tgm3Q08189 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tgm3Q08189 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tgm3Q08189 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tgm3Q08189 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tgm3Q08189 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tgm3Q08189 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tgm3Q08189 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tgm3Q08189 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tgm3Q08189 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tgm3Q08189 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tgm3Q08189 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tgm3Q08189 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tgm3Q08189 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tgm3Q08189 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tgm3Q08189 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tgm3Q08189 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tgm3Q08189 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tgm3Q08189 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tgm3Q08189 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tgm3Q08189 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tgm3Q08189 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tgm3Q08189 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tgm3Q08189 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tgm3Q08189 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tgm3Q08189 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tgm3Q08189 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tgm3Q08189 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tgm3Q08189 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tgm3Q08189 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tgm3Q08189 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tgm3Q08189 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tgm3Q08189 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tgm3Q08189 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tgm3Q08189 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tgm3Q08189 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tgm3Q08189 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tgm3Q08189 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tgm3Q08189 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tgm3Q08189 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tgm3Q08189 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tgm3Q08189 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tgm3Q08189 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tgm3Q08189 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tgm3Q08189 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tgm3Q08189 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tgm3Q08189 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tgm3Q08189 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tgm3Q08189 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tgm3Q08189 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tgm3Q08189 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tgm3Q08189 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tgm3Q08189 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tgm3Q08189 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tgm3Q08189 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Tgm3Q08189 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tgm3Q08189 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tgm3Q08189 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tgm3Q08189 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tgm3Q08189 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tgm3Q08189 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tgm3Q08189 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tgm3Q08189 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tgm3Q08189 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tgm3Q08189 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tgm3Q08189 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tgm3Q08189 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tgm3Q08189 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tgm3Q08189 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tgm3Q08189 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tgm3Q08189 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tgm3Q08189 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tgm3Q08189 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tgm3Q08189 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tgm3Q08189 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tgm3Q08189 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tgm3Q08189 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tgm3Q08189 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tgm3Q08189 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tgm3Q08189 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tgm3Q08189 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tgm3Q08189 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tgm3Q08189 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tgm3Q08189 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tgm3Q08189 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tgm3Q08189 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tgm3Q08189 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tgm3Q08189 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tgm3Q08189 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms